Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GGCXP38435 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
GGCXP38435 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GGCXP38435 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GGCXP38435 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GGCXP38435 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GGCXP38435 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GGCXP38435 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GGCXP38435 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GGCXP38435 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GGCXP38435 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GGCXP38435 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GGCXP38435 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GGCXP38435 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GGCXP38435 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GGCXP38435 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GGCXP38435 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GGCXP38435 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GGCXP38435 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GGCXP38435 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GGCXP38435 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GGCXP38435 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GGCXP38435 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GGCXP38435 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GGCXP38435 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GGCXP38435 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GGCXP38435 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GGCXP38435 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GGCXP38435 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GGCXP38435 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GGCXP38435 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GGCXP38435 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GGCXP38435 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GGCXP38435 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GGCXP38435 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GGCXP38435 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GGCXP38435 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GGCXP38435 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GGCXP38435 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GGCXP38435 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GGCXP38435 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GGCXP38435 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GGCXP38435 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GGCXP38435 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GGCXP38435 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GGCXP38435 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GGCXP38435 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GGCXP38435 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GGCXP38435 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GGCXP38435 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GGCXP38435 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GGCXP38435 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
GGCXP38435 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GGCXP38435 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GGCXP38435 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GGCXP38435 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GGCXP38435 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GGCXP38435 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GGCXP38435 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GGCXP38435 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GGCXP38435 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GGCXP38435 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GGCXP38435 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GGCXP38435 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GGCXP38435 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GGCXP38435 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
GGCXP38435 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
GGCXP38435 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GGCXP38435 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GGCXP38435 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GGCXP38435 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GGCXP38435 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GGCXP38435 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GGCXP38435 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GGCXP38435 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
GGCXP38435 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GGCXP38435 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GGCXP38435 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GGCXP38435 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GGCXP38435 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GGCXP38435 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GGCXP38435 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GGCXP38435 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GGCXP38435 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GGCXP38435 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GGCXP38435 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GGCXP38435 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GGCXP38435 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GGCXP38435 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GGCXP38435 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GGCXP38435 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GGCXP38435 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GGCXP38435 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GGCXP38435 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GGCXP38435 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GGCXP38435 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGCXP38435 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGCXP38435 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGCXP38435 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GGCXP38435 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms