Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC8A1P32418 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC8A1P32418 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC8A1P32418 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC8A1P32418 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC8A1P32418 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC8A1P32418 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC8A1P32418 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC8A1P32418 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC8A1P32418 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC8A1P32418 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC8A1P32418 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC8A1P32418 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC8A1P32418 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC8A1P32418 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC8A1P32418 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC8A1P32418 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC8A1P32418 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC8A1P32418 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC8A1P32418 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC8A1P32418 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC8A1P32418 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC8A1P32418 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC8A1P32418 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC8A1P32418 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC8A1P32418 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC8A1P32418 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC8A1P32418 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC8A1P32418 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC8A1P32418 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC8A1P32418 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC8A1P32418 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC8A1P32418 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC8A1P32418 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC8A1P32418 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC8A1P32418 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC8A1P32418 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC8A1P32418 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC8A1P32418 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC8A1P32418 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC8A1P32418 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC8A1P32418 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC8A1P32418 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC8A1P32418 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC8A1P32418 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC8A1P32418 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC8A1P32418 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC8A1P32418 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC8A1P32418 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC8A1P32418 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC8A1P32418 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLC8A1P32418 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC8A1P32418 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC8A1P32418 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC8A1P32418 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC8A1P32418 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC8A1P32418 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC8A1P32418 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC8A1P32418 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC8A1P32418 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC8A1P32418 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC8A1P32418 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC8A1P32418 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC8A1P32418 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC8A1P32418 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC8A1P32418 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC8A1P32418 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC8A1P32418 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC8A1P32418 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC8A1P32418 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC8A1P32418 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC8A1P32418 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC8A1P32418 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC8A1P32418 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC8A1P32418 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC8A1P32418 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC8A1P32418 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC8A1P32418 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC8A1P32418 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC8A1P32418 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC8A1P32418 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC8A1P32418 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC8A1P32418 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC8A1P32418 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC8A1P32418 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC8A1P32418 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC8A1P32418 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC8A1P32418 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC8A1P32418 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC8A1P32418 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC8A1P32418 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC8A1P32418 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC8A1P32418 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC8A1P32418 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC8A1P32418 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC8A1P32418 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC8A1P32418 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC8A1P32418 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC8A1P32418 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC8A1P32418 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms