Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMB5P28074 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMB5P28074 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMB5P28074 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMB5P28074 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMB5P28074 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMB5P28074 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMB5P28074 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMB5P28074 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMB5P28074 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMB5P28074 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMB5P28074 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMB5P28074 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMB5P28074 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMB5P28074 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMB5P28074 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMB5P28074 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMB5P28074 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMB5P28074 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMB5P28074 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMB5P28074 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMB5P28074 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMB5P28074 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PSMB5P28074 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMB5P28074 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMB5P28074 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMB5P28074 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMB5P28074 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMB5P28074 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMB5P28074 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMB5P28074 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMB5P28074 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMB5P28074 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMB5P28074 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMB5P28074 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMB5P28074 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMB5P28074 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMB5P28074 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMB5P28074 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMB5P28074 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMB5P28074 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMB5P28074 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMB5P28074 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMB5P28074 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMB5P28074 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMB5P28074 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMB5P28074 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMB5P28074 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMB5P28074 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMB5P28074 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMB5P28074 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMB5P28074 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMB5P28074 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMB5P28074 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMB5P28074 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMB5P28074 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMB5P28074 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMB5P28074 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMB5P28074 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMB5P28074 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMB5P28074 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMB5P28074 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMB5P28074 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMB5P28074 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMB5P28074 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PSMB5P28074 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PSMB5P28074 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PSMB5P28074 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMB5P28074 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMB5P28074 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMB5P28074 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMB5P28074 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMB5P28074 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMB5P28074 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMB5P28074 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMB5P28074 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMB5P28074 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMB5P28074 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMB5P28074 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB5P28074 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMB5P28074 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMB5P28074 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMB5P28074 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMB5P28074 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMB5P28074 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMB5P28074 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMB5P28074 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms