Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFYAP23511 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFYAP23511 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFYAP23511 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFYAP23511 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFYAP23511 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFYAP23511 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFYAP23511 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFYAP23511 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFYAP23511 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFYAP23511 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFYAP23511 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFYAP23511 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFYAP23511 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFYAP23511 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFYAP23511 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFYAP23511 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFYAP23511 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFYAP23511 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFYAP23511 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFYAP23511 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFYAP23511 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFYAP23511 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFYAP23511 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFYAP23511 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFYAP23511 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFYAP23511 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFYAP23511 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFYAP23511 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFYAP23511 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFYAP23511 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFYAP23511 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFYAP23511 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFYAP23511 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NFYAP23511 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFYAP23511 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFYAP23511 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFYAP23511 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFYAP23511 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFYAP23511 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFYAP23511 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFYAP23511 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFYAP23511 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFYAP23511 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFYAP23511 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFYAP23511 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFYAP23511 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFYAP23511 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFYAP23511 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NFYAP23511 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFYAP23511 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFYAP23511 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFYAP23511 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFYAP23511 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFYAP23511 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFYAP23511 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFYAP23511 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFYAP23511 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFYAP23511 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFYAP23511 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFYAP23511 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFYAP23511 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFYAP23511 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFYAP23511 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFYAP23511 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFYAP23511 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFYAP23511 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFYAP23511 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFYAP23511 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFYAP23511 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFYAP23511 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFYAP23511 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFYAP23511 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFYAP23511 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFYAP23511 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFYAP23511 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFYAP23511 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFYAP23511 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFYAP23511 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFYAP23511 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFYAP23511 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFYAP23511 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFYAP23511 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFYAP23511 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFYAP23511 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFYAP23511 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFYAP23511 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFYAP23511 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFYAP23511 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFYAP23511 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFYAP23511 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFYAP23511 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFYAP23511 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NFYAP23511 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFYAP23511 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFYAP23511 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFYAP23511 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFYAP23511 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFYAP23511 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFYAP23511 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms