Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCSHP23434 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCSHP23434 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCSHP23434 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCSHP23434 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCSHP23434 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCSHP23434 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GCSHP23434 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GCSHP23434 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCSHP23434 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GCSHP23434 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCSHP23434 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCSHP23434 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GCSHP23434 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCSHP23434 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCSHP23434 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GCSHP23434 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCSHP23434 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GCSHP23434 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCSHP23434 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCSHP23434 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCSHP23434 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCSHP23434 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GCSHP23434 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCSHP23434 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCSHP23434 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCSHP23434 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCSHP23434 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCSHP23434 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCSHP23434 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCSHP23434 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCSHP23434 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCSHP23434 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GCSHP23434 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCSHP23434 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GCSHP23434 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCSHP23434 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCSHP23434 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GCSHP23434 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GCSHP23434 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCSHP23434 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCSHP23434 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCSHP23434 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCSHP23434 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCSHP23434 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCSHP23434 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCSHP23434 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCSHP23434 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCSHP23434 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCSHP23434 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCSHP23434 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCSHP23434 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCSHP23434 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCSHP23434 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCSHP23434 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCSHP23434 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCSHP23434 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCSHP23434 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCSHP23434 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCSHP23434 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCSHP23434 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCSHP23434 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCSHP23434 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCSHP23434 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCSHP23434 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCSHP23434 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCSHP23434 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GCSHP23434 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCSHP23434 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCSHP23434 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCSHP23434 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCSHP23434 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCSHP23434 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCSHP23434 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCSHP23434 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCSHP23434 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCSHP23434 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCSHP23434 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCSHP23434 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCSHP23434 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GCSHP23434 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GCSHP23434 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCSHP23434 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCSHP23434 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCSHP23434 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCSHP23434 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCSHP23434 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCSHP23434 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCSHP23434 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCSHP23434 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCSHP23434 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GCSHP23434 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCSHP23434 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCSHP23434 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCSHP23434 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCSHP23434 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCSHP23434 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCSHP23434 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCSHP23434 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCSHP23434 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms