Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP6V1C1P21283 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP6V1C1P21283 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP6V1C1P21283 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP6V1C1P21283 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP6V1C1P21283 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP6V1C1P21283 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP6V1C1P21283 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP6V1C1P21283 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP6V1C1P21283 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP6V1C1P21283 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP6V1C1P21283 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP6V1C1P21283 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP6V1C1P21283 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP6V1C1P21283 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP6V1C1P21283 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP6V1C1P21283 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP6V1C1P21283 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP6V1C1P21283 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP6V1C1P21283 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP6V1C1P21283 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP6V1C1P21283 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP6V1C1P21283 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP6V1C1P21283 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP6V1C1P21283 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP6V1C1P21283 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP6V1C1P21283 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP6V1C1P21283 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP6V1C1P21283 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP6V1C1P21283 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP6V1C1P21283 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP6V1C1P21283 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP6V1C1P21283 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP6V1C1P21283 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP6V1C1P21283 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP6V1C1P21283 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP6V1C1P21283 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V1C1P21283 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1C1P21283 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1C1P21283 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V1C1P21283 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V1C1P21283 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V1C1P21283 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V1C1P21283 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V1C1P21283 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP6V1C1P21283 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP6V1C1P21283 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP6V1C1P21283 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP6V1C1P21283 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATP6V1C1P21283 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP6V1C1P21283 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V1C1P21283 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP6V1C1P21283 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP6V1C1P21283 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP6V1C1P21283 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP6V1C1P21283 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP6V1C1P21283 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP6V1C1P21283 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP6V1C1P21283 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP6V1C1P21283 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP6V1C1P21283 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP6V1C1P21283 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP6V1C1P21283 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP6V1C1P21283 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP6V1C1P21283 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP6V1C1P21283 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP6V1C1P21283 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP6V1C1P21283 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP6V1C1P21283 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP6V1C1P21283 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP6V1C1P21283 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP6V1C1P21283 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP6V1C1P21283 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP6V1C1P21283 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP6V1C1P21283 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP6V1C1P21283 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP6V1C1P21283 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP6V1C1P21283 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP6V1C1P21283 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP6V1C1P21283 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP6V1C1P21283 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V1C1P21283 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V1C1P21283 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP6V1C1P21283 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP6V1C1P21283 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP6V1C1P21283 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP6V1C1P21283 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP6V1C1P21283 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP6V1C1P21283 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP6V1C1P21283 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP6V1C1P21283 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V1C1P21283 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP6V1C1P21283 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V1C1P21283 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V1C1P21283 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP6V1C1P21283 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP6V1C1P21283 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP6V1C1P21283 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP6V1C1P21283 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP6V1C1P21283 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms