Protein–RNA interactions for Protein: P20382

PMCH, Pro-MCH, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHP20382 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMCHP20382 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMCHP20382 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMCHP20382 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PMCHP20382 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PMCHP20382 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PMCHP20382 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PMCHP20382 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMCHP20382 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMCHP20382 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMCHP20382 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMCHP20382 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMCHP20382 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PMCHP20382 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMCHP20382 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMCHP20382 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMCHP20382 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMCHP20382 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMCHP20382 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMCHP20382 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMCHP20382 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMCHP20382 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMCHP20382 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMCHP20382 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMCHP20382 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMCHP20382 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMCHP20382 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMCHP20382 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMCHP20382 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMCHP20382 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMCHP20382 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMCHP20382 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMCHP20382 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMCHP20382 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMCHP20382 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMCHP20382 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMCHP20382 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMCHP20382 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMCHP20382 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMCHP20382 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PMCHP20382 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMCHP20382 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMCHP20382 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMCHP20382 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PMCHP20382 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMCHP20382 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PMCHP20382 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMCHP20382 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMCHP20382 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMCHP20382 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMCHP20382 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMCHP20382 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMCHP20382 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMCHP20382 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMCHP20382 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMCHP20382 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMCHP20382 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMCHP20382 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMCHP20382 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMCHP20382 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMCHP20382 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMCHP20382 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMCHP20382 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMCHP20382 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMCHP20382 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMCHP20382 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMCHP20382 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMCHP20382 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PMCHP20382 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMCHP20382 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMCHP20382 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMCHP20382 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMCHP20382 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMCHP20382 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMCHP20382 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMCHP20382 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMCHP20382 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMCHP20382 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMCHP20382 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMCHP20382 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PMCHP20382 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PMCHP20382 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMCHP20382 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMCHP20382 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMCHP20382 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMCHP20382 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMCHP20382 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMCHP20382 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMCHP20382 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMCHP20382 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMCHP20382 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMCHP20382 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMCHP20382 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMCHP20382 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMCHP20382 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMCHP20382 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMCHP20382 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMCHP20382 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMCHP20382 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMCHP20382 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms