Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE6GP18545 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE6GP18545 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE6GP18545 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE6GP18545 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE6GP18545 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE6GP18545 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE6GP18545 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE6GP18545 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE6GP18545 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE6GP18545 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE6GP18545 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDE6GP18545 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE6GP18545 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDE6GP18545 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE6GP18545 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDE6GP18545 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDE6GP18545 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE6GP18545 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE6GP18545 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE6GP18545 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE6GP18545 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6GP18545 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE6GP18545 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE6GP18545 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE6GP18545 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE6GP18545 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE6GP18545 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE6GP18545 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6GP18545 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6GP18545 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6GP18545 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6GP18545 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE6GP18545 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE6GP18545 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE6GP18545 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE6GP18545 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE6GP18545 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE6GP18545 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDE6GP18545 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE6GP18545 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE6GP18545 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDE6GP18545 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE6GP18545 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDE6GP18545 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE6GP18545 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDE6GP18545 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE6GP18545 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE6GP18545 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE6GP18545 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE6GP18545 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE6GP18545 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE6GP18545 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE6GP18545 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE6GP18545 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE6GP18545 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE6GP18545 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE6GP18545 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE6GP18545 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE6GP18545 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE6GP18545 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE6GP18545 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE6GP18545 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE6GP18545 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE6GP18545 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE6GP18545 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE6GP18545 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDE6GP18545 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDE6GP18545 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE6GP18545 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE6GP18545 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE6GP18545 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDE6GP18545 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE6GP18545 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE6GP18545 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE6GP18545 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE6GP18545 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDE6GP18545 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE6GP18545 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE6GP18545 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE6GP18545 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE6GP18545 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE6GP18545 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDE6GP18545 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6GP18545 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDE6GP18545 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms