Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RD3LP0DJH9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RD3LP0DJH9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RD3LP0DJH9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RD3LP0DJH9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RD3LP0DJH9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RD3LP0DJH9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RD3LP0DJH9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RD3LP0DJH9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RD3LP0DJH9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3LP0DJH9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RD3LP0DJH9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RD3LP0DJH9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RD3LP0DJH9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RD3LP0DJH9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RD3LP0DJH9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RD3LP0DJH9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RD3LP0DJH9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RD3LP0DJH9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RD3LP0DJH9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RD3LP0DJH9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3LP0DJH9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3LP0DJH9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3LP0DJH9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RD3LP0DJH9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RD3LP0DJH9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RD3LP0DJH9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RD3LP0DJH9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RD3LP0DJH9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3LP0DJH9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3LP0DJH9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3LP0DJH9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3LP0DJH9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RD3LP0DJH9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RD3LP0DJH9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RD3LP0DJH9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RD3LP0DJH9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RD3LP0DJH9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RD3LP0DJH9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RD3LP0DJH9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RD3LP0DJH9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3LP0DJH9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3LP0DJH9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3LP0DJH9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3LP0DJH9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3LP0DJH9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RD3LP0DJH9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RD3LP0DJH9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RD3LP0DJH9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RD3LP0DJH9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3LP0DJH9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3LP0DJH9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RD3LP0DJH9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RD3LP0DJH9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RD3LP0DJH9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RD3LP0DJH9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RD3LP0DJH9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RD3LP0DJH9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RD3LP0DJH9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RD3LP0DJH9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RD3LP0DJH9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RD3LP0DJH9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3LP0DJH9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RD3LP0DJH9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RD3LP0DJH9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RD3LP0DJH9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RD3LP0DJH9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RD3LP0DJH9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RD3LP0DJH9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RD3LP0DJH9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RD3LP0DJH9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RD3LP0DJH9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RD3LP0DJH9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RD3LP0DJH9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RD3LP0DJH9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3LP0DJH9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RD3LP0DJH9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3LP0DJH9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RD3LP0DJH9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RD3LP0DJH9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RD3LP0DJH9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RD3LP0DJH9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3LP0DJH9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3LP0DJH9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RD3LP0DJH9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RD3LP0DJH9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RD3LP0DJH9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms