Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
HOXB7P09629 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
HOXB7P09629 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
HOXB7P09629 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
HOXB7P09629 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
HOXB7P09629 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
HOXB7P09629 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
HOXB7P09629 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
HOXB7P09629 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
HOXB7P09629 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
HOXB7P09629 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
HOXB7P09629 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
HOXB7P09629 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
HOXB7P09629 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
HOXB7P09629 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
HOXB7P09629 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
HOXB7P09629 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HOXB7P09629 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HOXB7P09629 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
HOXB7P09629 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
HOXB7P09629 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
HOXB7P09629 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
HOXB7P09629 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HOXB7P09629 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HOXB7P09629 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
HOXB7P09629 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
HOXB7P09629 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
HOXB7P09629 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HOXB7P09629 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
HOXB7P09629 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
HOXB7P09629 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
HOXB7P09629 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
HOXB7P09629 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
HOXB7P09629 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
HOXB7P09629 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
HOXB7P09629 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
HOXB7P09629 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
HOXB7P09629 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HOXB7P09629 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
HOXB7P09629 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HOXB7P09629 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HOXB7P09629 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
HOXB7P09629 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HOXB7P09629 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
HOXB7P09629 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
HOXB7P09629 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HOXB7P09629 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
HOXB7P09629 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
HOXB7P09629 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HOXB7P09629 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HOXB7P09629 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
HOXB7P09629 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
HOXB7P09629 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
HOXB7P09629 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
HOXB7P09629 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
HOXB7P09629 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HOXB7P09629 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HOXB7P09629 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HOXB7P09629 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HOXB7P09629 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HOXB7P09629 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HOXB7P09629 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HOXB7P09629 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HOXB7P09629 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
HOXB7P09629 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
HOXB7P09629 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
HOXB7P09629 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
HOXB7P09629 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HOXB7P09629 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HOXB7P09629 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HOXB7P09629 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HOXB7P09629 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HOXB7P09629 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HOXB7P09629 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HOXB7P09629 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
HOXB7P09629 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
HOXB7P09629 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HOXB7P09629 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HOXB7P09629 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
HOXB7P09629 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
HOXB7P09629 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
HOXB7P09629 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
HOXB7P09629 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HOXB7P09629 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HOXB7P09629 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
HOXB7P09629 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
HOXB7P09629 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
HOXB7P09629 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HOXB7P09629 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HOXB7P09629 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
HOXB7P09629 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
HOXB7P09629 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HOXB7P09629 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
HOXB7P09629 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
HOXB7P09629 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
HOXB7P09629 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HOXB7P09629 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
HOXB7P09629 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HOXB7P09629 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HOXB7P09629 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.4 ms