Protein–RNA interactions for Protein: P08621

SNRNP70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP70P08621 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRNP70P08621 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP70P08621 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP70P08621 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP70P08621 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRNP70P08621 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP70P08621 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP70P08621 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP70P08621 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP70P08621 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP70P08621 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRNP70P08621 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRNP70P08621 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRNP70P08621 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP70P08621 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRNP70P08621 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRNP70P08621 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRNP70P08621 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP70P08621 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP70P08621 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRNP70P08621 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRNP70P08621 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP70P08621 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP70P08621 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP70P08621 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP70P08621 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP70P08621 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP70P08621 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP70P08621 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP70P08621 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP70P08621 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP70P08621 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRNP70P08621 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRNP70P08621 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP70P08621 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRNP70P08621 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRNP70P08621 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP70P08621 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP70P08621 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRNP70P08621 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRNP70P08621 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRNP70P08621 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRNP70P08621 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRNP70P08621 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRNP70P08621 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRNP70P08621 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRNP70P08621 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRNP70P08621 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP70P08621 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRNP70P08621 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRNP70P08621 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRNP70P08621 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP70P08621 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP70P08621 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP70P08621 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRNP70P08621 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRNP70P08621 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRNP70P08621 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRNP70P08621 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRNP70P08621 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRNP70P08621 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRNP70P08621 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRNP70P08621 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRNP70P08621 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRNP70P08621 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRNP70P08621 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP70P08621 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP70P08621 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP70P08621 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP70P08621 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP70P08621 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP70P08621 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP70P08621 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP70P08621 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP70P08621 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP70P08621 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP70P08621 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP70P08621 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRNP70P08621 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRNP70P08621 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms