Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC1P07992 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC1P07992 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERCC1P07992 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC1P07992 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC1P07992 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC1P07992 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC1P07992 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC1P07992 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC1P07992 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC1P07992 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC1P07992 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC1P07992 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC1P07992 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC1P07992 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERCC1P07992 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC1P07992 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC1P07992 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC1P07992 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC1P07992 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC1P07992 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC1P07992 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC1P07992 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC1P07992 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC1P07992 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC1P07992 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC1P07992 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC1P07992 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC1P07992 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC1P07992 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC1P07992 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC1P07992 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC1P07992 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC1P07992 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC1P07992 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC1P07992 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC1P07992 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC1P07992 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC1P07992 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC1P07992 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC1P07992 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC1P07992 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC1P07992 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC1P07992 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC1P07992 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC1P07992 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC1P07992 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC1P07992 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC1P07992 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC1P07992 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC1P07992 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC1P07992 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC1P07992 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC1P07992 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC1P07992 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC1P07992 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC1P07992 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC1P07992 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC1P07992 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC1P07992 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC1P07992 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC1P07992 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC1P07992 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC1P07992 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC1P07992 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC1P07992 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC1P07992 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC1P07992 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC1P07992 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC1P07992 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC1P07992 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC1P07992 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC1P07992 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC1P07992 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC1P07992 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC1P07992 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC1P07992 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC1P07992 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC1P07992 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC1P07992 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC1P07992 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC1P07992 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC1P07992 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC1P07992 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC1P07992 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC1P07992 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC1P07992 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC1P07992 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC1P07992 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC1P07992 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC1P07992 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC1P07992 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC1P07992 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC1P07992 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC1P07992 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC1P07992 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC1P07992 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC1P07992 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC1P07992 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC1P07992 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms