Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGAVP06756 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGAVP06756 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGAVP06756 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGAVP06756 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAVP06756 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAVP06756 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAVP06756 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAVP06756 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGAVP06756 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGAVP06756 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGAVP06756 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ITGAVP06756 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGAVP06756 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGAVP06756 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGAVP06756 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAVP06756 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGAVP06756 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAVP06756 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAVP06756 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAVP06756 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAVP06756 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAVP06756 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGAVP06756 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGAVP06756 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ITGAVP06756 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGAVP06756 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGAVP06756 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAVP06756 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAVP06756 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAVP06756 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAVP06756 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGAVP06756 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGAVP06756 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGAVP06756 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGAVP06756 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGAVP06756 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGAVP06756 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGAVP06756 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAVP06756 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGAVP06756 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAVP06756 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAVP06756 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGAVP06756 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAVP06756 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGAVP06756 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGAVP06756 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGAVP06756 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAVP06756 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGAVP06756 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGAVP06756 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAVP06756 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGAVP06756 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAVP06756 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAVP06756 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAVP06756 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGAVP06756 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGAVP06756 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAVP06756 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGAVP06756 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAVP06756 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAVP06756 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAVP06756 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAVP06756 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGAVP06756 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAVP06756 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAVP06756 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAVP06756 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAVP06756 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAVP06756 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGAVP06756 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAVP06756 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGAVP06756 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAVP06756 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGAVP06756 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAVP06756 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGAVP06756 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGAVP06756 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGAVP06756 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGAVP06756 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAVP06756 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGAVP06756 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAVP06756 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAVP06756 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGAVP06756 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGAVP06756 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAVP06756 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAVP06756 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAVP06756 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAVP06756 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAVP06756 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ITGAVP06756 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAVP06756 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGAVP06756 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGAVP06756 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAVP06756 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAVP06756 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAVP06756 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGAVP06756 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGAVP06756 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms