Protein–RNA interactions for Protein: P05787

KRT8, Keratin, type II cytoskeletal 8, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8P05787 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT8P05787 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT8P05787 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT8P05787 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT8P05787 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT8P05787 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT8P05787 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT8P05787 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT8P05787 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT8P05787 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT8P05787 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT8P05787 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT8P05787 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT8P05787 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT8P05787 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT8P05787 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT8P05787 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT8P05787 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT8P05787 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT8P05787 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT8P05787 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT8P05787 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT8P05787 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT8P05787 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT8P05787 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT8P05787 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT8P05787 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT8P05787 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT8P05787 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT8P05787 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT8P05787 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT8P05787 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT8P05787 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT8P05787 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT8P05787 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT8P05787 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT8P05787 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT8P05787 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT8P05787 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT8P05787 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT8P05787 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT8P05787 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT8P05787 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT8P05787 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT8P05787 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT8P05787 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT8P05787 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT8P05787 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT8P05787 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT8P05787 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT8P05787 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT8P05787 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT8P05787 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT8P05787 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT8P05787 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT8P05787 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT8P05787 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT8P05787 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT8P05787 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT8P05787 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT8P05787 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT8P05787 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT8P05787 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT8P05787 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT8P05787 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT8P05787 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT8P05787 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT8P05787 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT8P05787 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT8P05787 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT8P05787 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT8P05787 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT8P05787 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT8P05787 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT8P05787 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT8P05787 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT8P05787 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT8P05787 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT8P05787 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT8P05787 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT8P05787 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT8P05787 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT8P05787 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT8P05787 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT8P05787 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT8P05787 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT8P05787 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT8P05787 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT8P05787 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT8P05787 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT8P05787 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT8P05787 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT8P05787 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT8P05787 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT8P05787 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT8P05787 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT8P05787 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT8P05787 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT8P05787 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT8P05787 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms