Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TK1P04183 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TK1P04183 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TK1P04183 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TK1P04183 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TK1P04183 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TK1P04183 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TK1P04183 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TK1P04183 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TK1P04183 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TK1P04183 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TK1P04183 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TK1P04183 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TK1P04183 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TK1P04183 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TK1P04183 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TK1P04183 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TK1P04183 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TK1P04183 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TK1P04183 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TK1P04183 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TK1P04183 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TK1P04183 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TK1P04183 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TK1P04183 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TK1P04183 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TK1P04183 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TK1P04183 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TK1P04183 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TK1P04183 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TK1P04183 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TK1P04183 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TK1P04183 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TK1P04183 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TK1P04183 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TK1P04183 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TK1P04183 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TK1P04183 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TK1P04183 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TK1P04183 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TK1P04183 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TK1P04183 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TK1P04183 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TK1P04183 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TK1P04183 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TK1P04183 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TK1P04183 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TK1P04183 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TK1P04183 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TK1P04183 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TK1P04183 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TK1P04183 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TK1P04183 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TK1P04183 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TK1P04183 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TK1P04183 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TK1P04183 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TK1P04183 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TK1P04183 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TK1P04183 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TK1P04183 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TK1P04183 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TK1P04183 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TK1P04183 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TK1P04183 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TK1P04183 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TK1P04183 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TK1P04183 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TK1P04183 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TK1P04183 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TK1P04183 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TK1P04183 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TK1P04183 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TK1P04183 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TK1P04183 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TK1P04183 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TK1P04183 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TK1P04183 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TK1P04183 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TK1P04183 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TK1P04183 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TK1P04183 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TK1P04183 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TK1P04183 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TK1P04183 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TK1P04183 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TK1P04183 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TK1P04183 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TK1P04183 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TK1P04183 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TK1P04183 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TK1P04183 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TK1P04183 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TK1P04183 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TK1P04183 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TK1P04183 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TK1P04183 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TK1P04183 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK1P04183 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK1P04183 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms