Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPP00450 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPP00450 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPP00450 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPP00450 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CPP00450 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CPP00450 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CPP00450 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CPP00450 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CPP00450 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPP00450 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CPP00450 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CPP00450 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CPP00450 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPP00450 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPP00450 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPP00450 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPP00450 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPP00450 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPP00450 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPP00450 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CPP00450 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPP00450 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CPP00450 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPP00450 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPP00450 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPP00450 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPP00450 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPP00450 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPP00450 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPP00450 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPP00450 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CPP00450 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CPP00450 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPP00450 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CPP00450 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CPP00450 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPP00450 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPP00450 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPP00450 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPP00450 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPP00450 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPP00450 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPP00450 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPP00450 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CPP00450 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPP00450 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPP00450 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPP00450 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CPP00450 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPP00450 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPP00450 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPP00450 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPP00450 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPP00450 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPP00450 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPP00450 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPP00450 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPP00450 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPP00450 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPP00450 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPP00450 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPP00450 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CPP00450 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPP00450 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPP00450 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPP00450 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPP00450 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPP00450 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPP00450 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CPP00450 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPP00450 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPP00450 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPP00450 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPP00450 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPP00450 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPP00450 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPP00450 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPP00450 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPP00450 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPP00450 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPP00450 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPP00450 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPP00450 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CPP00450 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CPP00450 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPP00450 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPP00450 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPP00450 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPP00450 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPP00450 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPP00450 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPP00450 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPP00450 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPP00450 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPP00450 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPP00450 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPP00450 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CPP00450 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPP00450 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms