Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24DO94855 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC24DO94855 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC24DO94855 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC24DO94855 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC24DO94855 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC24DO94855 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC24DO94855 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC24DO94855 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC24DO94855 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC24DO94855 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC24DO94855 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC24DO94855 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC24DO94855 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC24DO94855 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC24DO94855 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC24DO94855 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC24DO94855 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC24DO94855 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24DO94855 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24DO94855 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC24DO94855 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC24DO94855 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC24DO94855 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC24DO94855 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC24DO94855 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC24DO94855 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24DO94855 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC24DO94855 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC24DO94855 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC24DO94855 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24DO94855 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24DO94855 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC24DO94855 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24DO94855 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24DO94855 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24DO94855 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24DO94855 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC24DO94855 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC24DO94855 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC24DO94855 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC24DO94855 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC24DO94855 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC24DO94855 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24DO94855 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24DO94855 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24DO94855 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24DO94855 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24DO94855 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24DO94855 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24DO94855 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC24DO94855 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC24DO94855 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC24DO94855 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC24DO94855 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24DO94855 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24DO94855 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC24DO94855 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC24DO94855 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC24DO94855 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24DO94855 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24DO94855 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24DO94855 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24DO94855 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC24DO94855 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC24DO94855 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC24DO94855 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24DO94855 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24DO94855 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24DO94855 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC24DO94855 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24DO94855 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24DO94855 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24DO94855 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24DO94855 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24DO94855 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24DO94855 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC24DO94855 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24DO94855 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC24DO94855 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24DO94855 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24DO94855 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24DO94855 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24DO94855 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC24DO94855 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC24DO94855 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC24DO94855 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms