Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG12O94817 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG12O94817 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG12O94817 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG12O94817 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG12O94817 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG12O94817 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG12O94817 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG12O94817 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG12O94817 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG12O94817 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG12O94817 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG12O94817 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG12O94817 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG12O94817 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG12O94817 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG12O94817 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG12O94817 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG12O94817 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG12O94817 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG12O94817 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG12O94817 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG12O94817 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG12O94817 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG12O94817 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG12O94817 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG12O94817 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG12O94817 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG12O94817 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG12O94817 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG12O94817 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG12O94817 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG12O94817 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG12O94817 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG12O94817 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG12O94817 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG12O94817 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG12O94817 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG12O94817 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG12O94817 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG12O94817 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG12O94817 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG12O94817 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG12O94817 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG12O94817 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG12O94817 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG12O94817 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG12O94817 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG12O94817 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG12O94817 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG12O94817 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG12O94817 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG12O94817 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG12O94817 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG12O94817 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG12O94817 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG12O94817 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG12O94817 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG12O94817 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG12O94817 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG12O94817 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG12O94817 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG12O94817 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG12O94817 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG12O94817 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG12O94817 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG12O94817 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG12O94817 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG12O94817 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG12O94817 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG12O94817 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG12O94817 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG12O94817 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG12O94817 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG12O94817 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG12O94817 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG12O94817 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG12O94817 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG12O94817 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG12O94817 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG12O94817 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG12O94817 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG12O94817 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG12O94817 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG12O94817 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG12O94817 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG12O94817 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG12O94817 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG12O94817 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG12O94817 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG12O94817 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG12O94817 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG12O94817 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG12O94817 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG12O94817 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG12O94817 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG12O94817 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG12O94817 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG12O94817 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG12O94817 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms