Protein–RNA interactions for Protein: O75971

SNAPC5, snRNA-activating protein complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC5O75971 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAPC5O75971 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAPC5O75971 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAPC5O75971 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAPC5O75971 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAPC5O75971 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAPC5O75971 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAPC5O75971 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAPC5O75971 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAPC5O75971 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAPC5O75971 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAPC5O75971 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAPC5O75971 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAPC5O75971 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAPC5O75971 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAPC5O75971 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAPC5O75971 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAPC5O75971 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAPC5O75971 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAPC5O75971 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAPC5O75971 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAPC5O75971 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAPC5O75971 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAPC5O75971 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAPC5O75971 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAPC5O75971 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAPC5O75971 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAPC5O75971 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNAPC5O75971 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAPC5O75971 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAPC5O75971 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAPC5O75971 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAPC5O75971 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAPC5O75971 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAPC5O75971 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAPC5O75971 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAPC5O75971 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAPC5O75971 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAPC5O75971 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAPC5O75971 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAPC5O75971 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAPC5O75971 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAPC5O75971 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAPC5O75971 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAPC5O75971 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAPC5O75971 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAPC5O75971 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAPC5O75971 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAPC5O75971 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAPC5O75971 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAPC5O75971 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAPC5O75971 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAPC5O75971 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAPC5O75971 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAPC5O75971 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAPC5O75971 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAPC5O75971 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAPC5O75971 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAPC5O75971 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAPC5O75971 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAPC5O75971 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAPC5O75971 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAPC5O75971 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAPC5O75971 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAPC5O75971 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAPC5O75971 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAPC5O75971 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAPC5O75971 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAPC5O75971 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNAPC5O75971 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAPC5O75971 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNAPC5O75971 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNAPC5O75971 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNAPC5O75971 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNAPC5O75971 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAPC5O75971 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAPC5O75971 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAPC5O75971 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNAPC5O75971 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAPC5O75971 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAPC5O75971 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNAPC5O75971 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNAPC5O75971 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAPC5O75971 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNAPC5O75971 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAPC5O75971 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAPC5O75971 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAPC5O75971 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAPC5O75971 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAPC5O75971 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAPC5O75971 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAPC5O75971 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAPC5O75971 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNAPC5O75971 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNAPC5O75971 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAPC5O75971 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNAPC5O75971 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAPC5O75971 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAPC5O75971 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNAPC5O75971 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms