Protein–RNA interactions for Protein: B4DS77

SHISA9, Protein shisa-9, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA9B4DS77 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA9B4DS77 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA9B4DS77 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA9B4DS77 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA9B4DS77 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA9B4DS77 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA9B4DS77 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA9B4DS77 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA9B4DS77 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHISA9B4DS77 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA9B4DS77 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA9B4DS77 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA9B4DS77 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA9B4DS77 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA9B4DS77 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA9B4DS77 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA9B4DS77 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA9B4DS77 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA9B4DS77 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA9B4DS77 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA9B4DS77 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA9B4DS77 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA9B4DS77 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA9B4DS77 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA9B4DS77 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA9B4DS77 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA9B4DS77 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA9B4DS77 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA9B4DS77 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA9B4DS77 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA9B4DS77 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA9B4DS77 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA9B4DS77 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA9B4DS77 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA9B4DS77 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA9B4DS77 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA9B4DS77 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA9B4DS77 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA9B4DS77 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHISA9B4DS77 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHISA9B4DS77 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA9B4DS77 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA9B4DS77 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA9B4DS77 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA9B4DS77 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA9B4DS77 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA9B4DS77 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA9B4DS77 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA9B4DS77 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA9B4DS77 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHISA9B4DS77 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHISA9B4DS77 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA9B4DS77 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA9B4DS77 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA9B4DS77 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA9B4DS77 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA9B4DS77 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA9B4DS77 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA9B4DS77 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA9B4DS77 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA9B4DS77 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA9B4DS77 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA9B4DS77 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHISA9B4DS77 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHISA9B4DS77 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHISA9B4DS77 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SHISA9B4DS77 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHISA9B4DS77 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHISA9B4DS77 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHISA9B4DS77 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHISA9B4DS77 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHISA9B4DS77 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHISA9B4DS77 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SHISA9B4DS77 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHISA9B4DS77 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHISA9B4DS77 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SHISA9B4DS77 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHISA9B4DS77 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHISA9B4DS77 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHISA9B4DS77 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHISA9B4DS77 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHISA9B4DS77 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHISA9B4DS77 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHISA9B4DS77 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHISA9B4DS77 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHISA9B4DS77 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHISA9B4DS77 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHISA9B4DS77 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHISA9B4DS77 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHISA9B4DS77 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHISA9B4DS77 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHISA9B4DS77 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHISA9B4DS77 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHISA9B4DS77 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHISA9B4DS77 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHISA9B4DS77 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHISA9B4DS77 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHISA9B4DS77 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA9B4DS77 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA9B4DS77 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms