Protein–RNA interactions for Protein: B4DS77

SHISA9, Protein shisa-9, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA9B4DS77 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHISA9B4DS77 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHISA9B4DS77 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHISA9B4DS77 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHISA9B4DS77 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHISA9B4DS77 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHISA9B4DS77 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SHISA9B4DS77 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHISA9B4DS77 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHISA9B4DS77 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHISA9B4DS77 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHISA9B4DS77 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHISA9B4DS77 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHISA9B4DS77 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHISA9B4DS77 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHISA9B4DS77 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHISA9B4DS77 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHISA9B4DS77 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHISA9B4DS77 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHISA9B4DS77 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHISA9B4DS77 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SHISA9B4DS77 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SHISA9B4DS77 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHISA9B4DS77 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHISA9B4DS77 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHISA9B4DS77 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHISA9B4DS77 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHISA9B4DS77 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHISA9B4DS77 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHISA9B4DS77 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA9B4DS77 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHISA9B4DS77 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHISA9B4DS77 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHISA9B4DS77 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHISA9B4DS77 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHISA9B4DS77 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHISA9B4DS77 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHISA9B4DS77 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHISA9B4DS77 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SHISA9B4DS77 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHISA9B4DS77 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA9B4DS77 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA9B4DS77 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SHISA9B4DS77 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA9B4DS77 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA9B4DS77 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA9B4DS77 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHISA9B4DS77 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHISA9B4DS77 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA9B4DS77 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA9B4DS77 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA9B4DS77 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHISA9B4DS77 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA9B4DS77 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHISA9B4DS77 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA9B4DS77 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHISA9B4DS77 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHISA9B4DS77 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA9B4DS77 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA9B4DS77 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA9B4DS77 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHISA9B4DS77 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHISA9B4DS77 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHISA9B4DS77 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA9B4DS77 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA9B4DS77 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA9B4DS77 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA9B4DS77 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHISA9B4DS77 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA9B4DS77 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA9B4DS77 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA9B4DS77 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA9B4DS77 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA9B4DS77 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHISA9B4DS77 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHISA9B4DS77 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA9B4DS77 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA9B4DS77 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA9B4DS77 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA9B4DS77 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA9B4DS77 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA9B4DS77 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA9B4DS77 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA9B4DS77 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA9B4DS77 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA9B4DS77 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA9B4DS77 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA9B4DS77 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA9B4DS77 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA9B4DS77 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHISA9B4DS77 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHISA9B4DS77 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SHISA9B4DS77 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA9B4DS77 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA9B4DS77 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA9B4DS77 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA9B4DS77 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA9B4DS77 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA9B4DS77 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA9B4DS77 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms