Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRBV30A0A0K0K1B3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRBV30A0A0K0K1B3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRBV30A0A0K0K1B3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRBV30A0A0K0K1B3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRBV30A0A0K0K1B3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRBV30A0A0K0K1B3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRBV30A0A0K0K1B3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRBV30A0A0K0K1B3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRBV30A0A0K0K1B3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRBV30A0A0K0K1B3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRBV30A0A0K0K1B3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRBV30A0A0K0K1B3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRBV30A0A0K0K1B3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRBV30A0A0K0K1B3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRBV30A0A0K0K1B3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRBV30A0A0K0K1B3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRBV30A0A0K0K1B3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRBV30A0A0K0K1B3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRBV30A0A0K0K1B3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRBV30A0A0K0K1B3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRBV30A0A0K0K1B3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRBV30A0A0K0K1B3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRBV30A0A0K0K1B3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRBV30A0A0K0K1B3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRBV30A0A0K0K1B3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRBV30A0A0K0K1B3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRBV30A0A0K0K1B3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRBV30A0A0K0K1B3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRBV30A0A0K0K1B3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRBV30A0A0K0K1B3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRBV30A0A0K0K1B3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRBV30A0A0K0K1B3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRBV30A0A0K0K1B3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRBV30A0A0K0K1B3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRBV30A0A0K0K1B3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRBV30A0A0K0K1B3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRBV30A0A0K0K1B3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRBV30A0A0K0K1B3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRBV30A0A0K0K1B3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRBV30A0A0K0K1B3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV30A0A0K0K1B3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRBV30A0A0K0K1B3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRBV30A0A0K0K1B3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRBV30A0A0K0K1B3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRBV30A0A0K0K1B3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRBV30A0A0K0K1B3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRBV30A0A0K0K1B3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRBV30A0A0K0K1B3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRBV30A0A0K0K1B3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRBV30A0A0K0K1B3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRBV30A0A0K0K1B3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRBV30A0A0K0K1B3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRBV30A0A0K0K1B3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRBV30A0A0K0K1B3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRBV30A0A0K0K1B3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRBV30A0A0K0K1B3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRBV30A0A0K0K1B3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRBV30A0A0K0K1B3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRBV30A0A0K0K1B3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRBV30A0A0K0K1B3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRBV30A0A0K0K1B3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRBV30A0A0K0K1B3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRBV30A0A0K0K1B3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRBV30A0A0K0K1B3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRBV30A0A0K0K1B3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRBV30A0A0K0K1B3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRBV30A0A0K0K1B3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRBV30A0A0K0K1B3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRBV30A0A0K0K1B3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRBV30A0A0K0K1B3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRBV30A0A0K0K1B3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRBV30A0A0K0K1B3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRBV30A0A0K0K1B3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRBV30A0A0K0K1B3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRBV30A0A0K0K1B3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRBV30A0A0K0K1B3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRBV30A0A0K0K1B3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRBV30A0A0K0K1B3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRBV30A0A0K0K1B3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRBV30A0A0K0K1B3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRBV30A0A0K0K1B3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRBV30A0A0K0K1B3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRBV30A0A0K0K1B3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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