Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAH9Q9NYC9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DNAH9Q9NYC9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAH9Q9NYC9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAH9Q9NYC9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAH9Q9NYC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAH9Q9NYC9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAH9Q9NYC9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAH9Q9NYC9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAH9Q9NYC9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAH9Q9NYC9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAH9Q9NYC9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAH9Q9NYC9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms