Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
COL24A1Q17RW2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
COL24A1Q17RW2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL24A1Q17RW2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
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