RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588737.5

RPRD1A-207, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPRD1A, Length 1,264 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1A-207ENST00000588737 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.31■■■■■ 6.45
RPRD1A-207ENST00000588737 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.37■■■■■ 5.49
RPRD1A-207ENST00000588737 ABCC9O60706 1549 aa49.08■■■■■ 5.45
RPRD1A-207ENST00000588737 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.86■■■■■ 5.09
RPRD1A-207ENST00000588737 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.76■■■■■ 5.08
RPRD1A-207ENST00000588737 NACADO15069 1562 aa46.64■■■■■ 5.06
RPRD1A-207ENST00000588737 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.11■■■■■ 4.97
RPRD1A-207ENST00000588737 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
RPRD1A-207ENST00000588737 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.84■■■■■ 4.93
RPRD1A-207ENST00000588737 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.69■■■■■ 4.9
RPRD1A-207ENST00000588737 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.68■■■■■ 4.9
RPRD1A-207ENST00000588737 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.68■■■■■ 4.9
RPRD1A-207ENST00000588737 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.41■■■■■ 4.86
RPRD1A-207ENST00000588737 SCRIBQ14160 1630 aa45.07■■■■■ 4.81
RPRD1A-207ENST00000588737 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.85■■■■■ 4.77
RPRD1A-207ENST00000588737 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.3■■■■■ 4.68
RPRD1A-207ENST00000588737 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.29■■■■■ 4.68
RPRD1A-207ENST00000588737 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.15■■■■■ 4.66
RPRD1A-207ENST00000588737 NCAPD3P42695 1498 aa43.08■■■■■ 4.49
RPRD1A-207ENST00000588737 SMARCA4P51532 1647 aa43.02■■■■■ 4.48
RPRD1A-207ENST00000588737 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43■■■■■ 4.47
RPRD1A-207ENST00000588737 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
RPRD1A-207ENST00000588737 SMARCA2P51531 1590 aa42.9■■■■■ 4.46
RPRD1A-207ENST00000588737 HMGXB3Q12766 1538 aa42.73■■■■■ 4.43
RPRD1A-207ENST00000588737 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.42
RPRD1A-207ENST00000588737 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.63■■■■■ 4.41
RPRD1A-207ENST00000588737 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.57■■■■■ 4.41
RPRD1A-207ENST00000588737 ERCC6Q03468 1493 aa42.36■■■■■ 4.37
RPRD1A-207ENST00000588737 NESP48681 1621 aa42.25■■■■■ 4.35
RPRD1A-207ENST00000588737 WIZO95785 1651 aa42.12■■■■■ 4.33
RPRD1A-207ENST00000588737 CUX2O14529 1486 aa42.07■■■■■ 4.33
RPRD1A-207ENST00000588737 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.01■■■■■ 4.32
RPRD1A-207ENST00000588737 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
RPRD1A-207ENST00000588737 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.84■■■■■ 4.29
RPRD1A-207ENST00000588737 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.83■■■■■ 4.29
RPRD1A-207ENST00000588737 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.65■■■■■ 4.26
RPRD1A-207ENST00000588737 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.65■■■■■ 4.26
RPRD1A-207ENST00000588737 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
RPRD1A-207ENST00000588737 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
RPRD1A-207ENST00000588737 CFTRP13569 1480 aa41.4■■■■■ 4.22
RPRD1A-207ENST00000588737 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.39■■■■■ 4.22
RPRD1A-207ENST00000588737 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.33■■■■■ 4.21
RPRD1A-207ENST00000588737 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.32■■■■■ 4.2
RPRD1A-207ENST00000588737 WDR62O43379 1518 aa41.22■■■■■ 4.19
RPRD1A-207ENST00000588737 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.21■■■■■ 4.19
RPRD1A-207ENST00000588737 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
RPRD1A-207ENST00000588737 PRDM2Q13029 1718 aa40.9■■■■■ 4.14
RPRD1A-207ENST00000588737 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
RPRD1A-207ENST00000588737 TOPBP1Q92547 1522 aa40.57■■■■■ 4.09
RPRD1A-207ENST00000588737 ABCC8Q09428 1581 aa40.57■■■■■ 4.08
RPRD1A-207ENST00000588737 IFT140Q96RY7 1462 aa40.49■■■■■ 4.07
RPRD1A-207ENST00000588737 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.44■■■■■ 4.06
RPRD1A-207ENST00000588737 OSCARQ8IYS5 282 aa40.37■■■■■ 4.05
RPRD1A-207ENST00000588737 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
RPRD1A-207ENST00000588737 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
RPRD1A-207ENST00000588737 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
RPRD1A-207ENST00000588737 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.11■■■■■ 4.01
RPRD1A-207ENST00000588737 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
RPRD1A-207ENST00000588737 SOGA1O94964 1423 aa40.09■■■■■ 4.01
RPRD1A-207ENST00000588737 TRIM41Q8WV44 630 aa40.08■■■■■ 4.01
RPRD1A-207ENST00000588737 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.07■■■■■ 4
RPRD1A-207ENST00000588737 CUX1P39880 1505 aa40.01■■■■□ 3.99
RPRD1A-207ENST00000588737 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40■■■■□ 3.99
RPRD1A-207ENST00000588737 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
RPRD1A-207ENST00000588737 FBLN2P98095 1184 aa39.88■■■■□ 3.97
RPRD1A-207ENST00000588737 WDR97A6NE52 1622 aa39.74■■■■□ 3.95
RPRD1A-207ENST00000588737 CHD1O14646 1710 aa39.72■■■■□ 3.95
RPRD1A-207ENST00000588737 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.66■■■■□ 3.94
RPRD1A-207ENST00000588737 GRIN2BQ13224 1484 aa39.64■■■■□ 3.94
RPRD1A-207ENST00000588737 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.63■■■■□ 3.93
RPRD1A-207ENST00000588737 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.63■■■■□ 3.93
RPRD1A-207ENST00000588737 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.63■■■■□ 3.93
RPRD1A-207ENST00000588737 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
RPRD1A-207ENST00000588737 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.57■■■■□ 3.93
RPRD1A-207ENST00000588737 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.57■■■■□ 3.93
RPRD1A-207ENST00000588737 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
RPRD1A-207ENST00000588737 ARHGEF11O15085 1522 aa39.57■■■■□ 3.93
RPRD1A-207ENST00000588737 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.57■■■■□ 3.93
RPRD1A-207ENST00000588737 TOP2BQ02880 1626 aa39.48■■■■□ 3.91
RPRD1A-207ENST00000588737 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.45■■■■□ 3.91
RPRD1A-207ENST00000588737 SYNJ2O15056 1496 aa39.44■■■■□ 3.9
RPRD1A-207ENST00000588737 SYNJ1O43426 1573 aa39.44■■■■□ 3.9
RPRD1A-207ENST00000588737 PBRM1Q86U86 1689 aa39.42■■■■□ 3.9
RPRD1A-207ENST00000588737 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.41■■■■□ 3.9
RPRD1A-207ENST00000588737 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.4■■■■□ 3.9
RPRD1A-207ENST00000588737 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.28■■■■□ 3.88
RPRD1A-207ENST00000588737 ARAP1Q96P48 1450 aa39.2■■■■□ 3.87
RPRD1A-207ENST00000588737 GRIN2AQ12879 1464 aa39.11■■■■□ 3.85
RPRD1A-207ENST00000588737 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.09■■■■□ 3.85
RPRD1A-207ENST00000588737 ADAMTS12P58397 1594 aa39.08■■■■□ 3.85
RPRD1A-207ENST00000588737 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.07■■■■□ 3.84
RPRD1A-207ENST00000588737 NUP160Q12769 1436 aa38.95■■■■□ 3.83
RPRD1A-207ENST00000588737 CEP170Q5SW79 1584 aa38.91■■■■□ 3.82
RPRD1A-207ENST00000588737 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
RPRD1A-207ENST00000588737 KIF27Q86VH2 1401 aa38.82■■■■□ 3.81
RPRD1A-207ENST00000588737 IGF1RP08069 1367 aa38.76■■■■□ 3.8
RPRD1A-207ENST00000588737 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.73■■■■□ 3.79
RPRD1A-207ENST00000588737 JPH4Q96JJ6 628 aa38.69■■■■□ 3.78
RPRD1A-207ENST00000588737 SHROOM2Q13796 1616 aa38.67■■■■□ 3.78
RPRD1A-207ENST00000588737 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms