Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
COL24A1Q17RW2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
COL24A1Q17RW2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.97■■■■■ 4.63
COL24A1Q17RW2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
COL24A1Q17RW2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
COL24A1Q17RW2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
COL24A1Q17RW2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
COL24A1Q17RW2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
COL24A1Q17RW2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
COL24A1Q17RW2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
COL24A1Q17RW2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
COL24A1Q17RW2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
COL24A1Q17RW2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
COL24A1Q17RW2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
COL24A1Q17RW2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
COL24A1Q17RW2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
COL24A1Q17RW2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
COL24A1Q17RW2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
COL24A1Q17RW2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
COL24A1Q17RW2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
COL24A1Q17RW2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
COL24A1Q17RW2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
COL24A1Q17RW2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
COL24A1Q17RW2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
COL24A1Q17RW2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
COL24A1Q17RW2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
COL24A1Q17RW2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
COL24A1Q17RW2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
COL24A1Q17RW2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
COL24A1Q17RW2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
COL24A1Q17RW2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
COL24A1Q17RW2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
COL24A1Q17RW2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
COL24A1Q17RW2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
COL24A1Q17RW2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
COL24A1Q17RW2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
COL24A1Q17RW2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC40.04■■■■■ 4
COL24A1Q17RW2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
COL24A1Q17RW2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
COL24A1Q17RW2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
COL24A1Q17RW2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
COL24A1Q17RW2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
COL24A1Q17RW2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
COL24A1Q17RW2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
COL24A1Q17RW2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
COL24A1Q17RW2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
COL24A1Q17RW2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
COL24A1Q17RW2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
COL24A1Q17RW2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
COL24A1Q17RW2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
COL24A1Q17RW2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
COL24A1Q17RW2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
COL24A1Q17RW2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
COL24A1Q17RW2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
COL24A1Q17RW2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
COL24A1Q17RW2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
COL24A1Q17RW2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
COL24A1Q17RW2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
COL24A1Q17RW2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
COL24A1Q17RW2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
COL24A1Q17RW2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
COL24A1Q17RW2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
COL24A1Q17RW2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
COL24A1Q17RW2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
COL24A1Q17RW2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
COL24A1Q17RW2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
COL24A1Q17RW2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
COL24A1Q17RW2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
COL24A1Q17RW2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
COL24A1Q17RW2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
COL24A1Q17RW2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
COL24A1Q17RW2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
COL24A1Q17RW2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
COL24A1Q17RW2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
COL24A1Q17RW2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
COL24A1Q17RW2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
COL24A1Q17RW2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
COL24A1Q17RW2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
COL24A1Q17RW2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
COL24A1Q17RW2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
COL24A1Q17RW2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
COL24A1Q17RW2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
COL24A1Q17RW2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
COL24A1Q17RW2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
COL24A1Q17RW2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
COL24A1Q17RW2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
COL24A1Q17RW2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
COL24A1Q17RW2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
COL24A1Q17RW2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
COL24A1Q17RW2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
COL24A1Q17RW2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
COL24A1Q17RW2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
COL24A1Q17RW2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
COL24A1Q17RW2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
COL24A1Q17RW2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
COL24A1Q17RW2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
COL24A1Q17RW2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
COL24A1Q17RW2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
COL24A1Q17RW2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms