Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTAN1Q13813 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTAN1Q13813 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTAN1Q13813 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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