Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SPTAN1Q13813 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SPTAN1Q13813 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SPTAN1Q13813 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPTAN1Q13813 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPTAN1Q13813 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SPTAN1Q13813 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPTAN1Q13813 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPTAN1Q13813 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPTAN1Q13813 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPTAN1Q13813 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPTAN1Q13813 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPTAN1Q13813 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPTAN1Q13813 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPTAN1Q13813 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPTAN1Q13813 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPTAN1Q13813 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTAN1Q13813 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SPTAN1Q13813 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTAN1Q13813 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTAN1Q13813 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTAN1Q13813 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPTAN1Q13813 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPTAN1Q13813 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPTAN1Q13813 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SPTAN1Q13813 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPTAN1Q13813 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPTAN1Q13813 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPTAN1Q13813 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPTAN1Q13813 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTAN1Q13813 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTAN1Q13813 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTAN1Q13813 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTAN1Q13813 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTAN1Q13813 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SPTAN1Q13813 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPTAN1Q13813 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPTAN1Q13813 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPTAN1Q13813 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SPTAN1Q13813 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTAN1Q13813 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTAN1Q13813 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTAN1Q13813 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPTAN1Q13813 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPTAN1Q13813 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPTAN1Q13813 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTAN1Q13813 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTAN1Q13813 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTAN1Q13813 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTAN1Q13813 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTAN1Q13813 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTAN1Q13813 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTAN1Q13813 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTAN1Q13813 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTAN1Q13813 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTAN1Q13813 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTAN1Q13813 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTAN1Q13813 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTAN1Q13813 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTAN1Q13813 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPTAN1Q13813 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTAN1Q13813 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPTAN1Q13813 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTAN1Q13813 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTAN1Q13813 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTAN1Q13813 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTAN1Q13813 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTAN1Q13813 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTAN1Q13813 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTAN1Q13813 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTAN1Q13813 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTAN1Q13813 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTAN1Q13813 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTAN1Q13813 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTAN1Q13813 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTAN1Q13813 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTAN1Q13813 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTAN1Q13813 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTAN1Q13813 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTAN1Q13813 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTAN1Q13813 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTAN1Q13813 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTAN1Q13813 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTAN1Q13813 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPTAN1Q13813 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SPTAN1Q13813 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPTAN1Q13813 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPTAN1Q13813 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPTAN1Q13813 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPTAN1Q13813 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPTAN1Q13813 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SPTAN1Q13813 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPTAN1Q13813 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPTAN1Q13813 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPTAN1Q13813 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPTAN1Q13813 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPTAN1Q13813 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPTAN1Q13813 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPTAN1Q13813 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPTAN1Q13813 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
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