RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326961.6

HACD1-201, Transcript of 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HACD1, Length 773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1-201ENST00000326961 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.95■■■■■ 6.23
HACD1-201ENST00000326961 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.37■■■■■ 5.33
HACD1-201ENST00000326961 ABCC9O60706 1549 aa48.11■■■■■ 5.29
HACD1-201ENST00000326961 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.85■■■■■ 4.93
HACD1-201ENST00000326961 NACADO15069 1562 aa45.58■■■■■ 4.89
HACD1-201ENST00000326961 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.29■■■■■ 4.84
HACD1-201ENST00000326961 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.09■■■■■ 4.81
HACD1-201ENST00000326961 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.99■■■■■ 4.79
HACD1-201ENST00000326961 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.92■■■■■ 4.78
HACD1-201ENST00000326961 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
HACD1-201ENST00000326961 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.77■■■■■ 4.76
HACD1-201ENST00000326961 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.65■■■■■ 4.74
HACD1-201ENST00000326961 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.54■■■■■ 4.72
HACD1-201ENST00000326961 SCRIBQ14160 1630 aa44.13■■■■■ 4.66
HACD1-201ENST00000326961 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.85■■■■■ 4.61
HACD1-201ENST00000326961 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.51■■■■■ 4.56
HACD1-201ENST00000326961 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
HACD1-201ENST00000326961 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.26■■■■■ 4.52
HACD1-201ENST00000326961 SMARCA4P51532 1647 aa42.1■■■■■ 4.33
HACD1-201ENST00000326961 NCAPD3P42695 1498 aa42.04■■■■■ 4.32
HACD1-201ENST00000326961 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42■■■■■ 4.31
HACD1-201ENST00000326961 SMARCA2P51531 1590 aa41.87■■■■■ 4.29
HACD1-201ENST00000326961 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
HACD1-201ENST00000326961 HMGXB3Q12766 1538 aa41.81■■■■■ 4.28
HACD1-201ENST00000326961 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.65■■■■■ 4.26
HACD1-201ENST00000326961 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.64■■■■■ 4.26
HACD1-201ENST00000326961 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
HACD1-201ENST00000326961 NESP48681 1621 aa41.46■■■■■ 4.23
HACD1-201ENST00000326961 ERCC6Q03468 1493 aa41.43■■■■■ 4.22
HACD1-201ENST00000326961 CUX2O14529 1486 aa41.27■■■■■ 4.2
HACD1-201ENST00000326961 WIZO95785 1651 aa41.22■■■■■ 4.19
HACD1-201ENST00000326961 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.1■■■■■ 4.17
HACD1-201ENST00000326961 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
HACD1-201ENST00000326961 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.01■■■■■ 4.16
HACD1-201ENST00000326961 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.94■■■■■ 4.14
HACD1-201ENST00000326961 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
HACD1-201ENST00000326961 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.75■■■■■ 4.11
HACD1-201ENST00000326961 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.75■■■■■ 4.11
HACD1-201ENST00000326961 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
HACD1-201ENST00000326961 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.48■■■■■ 4.07
HACD1-201ENST00000326961 WDR62O43379 1518 aa40.42■■■■■ 4.06
HACD1-201ENST00000326961 CFTRP13569 1480 aa40.39■■■■■ 4.06
HACD1-201ENST00000326961 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.36■■■■■ 4.05
HACD1-201ENST00000326961 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.35■■■■■ 4.05
HACD1-201ENST00000326961 PRDM2Q13029 1718 aa40.22■■■■■ 4.03
HACD1-201ENST00000326961 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.13■■■■■ 4.02
HACD1-201ENST00000326961 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
HACD1-201ENST00000326961 TOPBP1Q92547 1522 aa39.66■■■■□ 3.94
HACD1-201ENST00000326961 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
HACD1-201ENST00000326961 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.54■■■■□ 3.92
HACD1-201ENST00000326961 IFT140Q96RY7 1462 aa39.52■■■■□ 3.92
HACD1-201ENST00000326961 ABCC8Q09428 1581 aa39.44■■■■□ 3.9
HACD1-201ENST00000326961 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.9
HACD1-201ENST00000326961 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
HACD1-201ENST00000326961 OSCARQ8IYS5 282 aa39.33■■■■□ 3.89
HACD1-201ENST00000326961 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.27■■■■□ 3.88
HACD1-201ENST00000326961 TRIM41Q8WV44 630 aa39.27■■■■□ 3.88
HACD1-201ENST00000326961 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.16■■■■□ 3.86
HACD1-201ENST00000326961 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.14■■■■□ 3.86
HACD1-201ENST00000326961 CHD1O14646 1710 aa39.12■■■■□ 3.85
HACD1-201ENST00000326961 CUX1P39880 1505 aa39.11■■■■□ 3.85
HACD1-201ENST00000326961 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
HACD1-201ENST00000326961 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.06■■■■□ 3.84
HACD1-201ENST00000326961 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.03■■■■□ 3.84
HACD1-201ENST00000326961 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.03■■■■□ 3.84
HACD1-201ENST00000326961 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.03■■■■□ 3.84
HACD1-201ENST00000326961 SOGA1O94964 1423 aa39■■■■□ 3.83
HACD1-201ENST00000326961 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
HACD1-201ENST00000326961 WDR97A6NE52 1622 aa38.91■■■■□ 3.82
HACD1-201ENST00000326961 ARHGEF11O15085 1522 aa38.88■■■■□ 3.81
HACD1-201ENST00000326961 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.79■■■■□ 3.8
HACD1-201ENST00000326961 FBLN2P98095 1184 aa38.75■■■■□ 3.79
HACD1-201ENST00000326961 PBRM1Q86U86 1689 aa38.72■■■■□ 3.79
HACD1-201ENST00000326961 GRIN2BQ13224 1484 aa38.66■■■■□ 3.78
HACD1-201ENST00000326961 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
HACD1-201ENST00000326961 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.62■■■■□ 3.77
HACD1-201ENST00000326961 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.59■■■■□ 3.77
HACD1-201ENST00000326961 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.58■■■■□ 3.77
HACD1-201ENST00000326961 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.57■■■■□ 3.77
HACD1-201ENST00000326961 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.56■■■■□ 3.76
HACD1-201ENST00000326961 SYNJ1O43426 1573 aa38.55■■■■□ 3.76
HACD1-201ENST00000326961 ARAP1Q96P48 1450 aa38.54■■■■□ 3.76
HACD1-201ENST00000326961 TOP2BQ02880 1626 aa38.52■■■■□ 3.76
HACD1-201ENST00000326961 SYNJ2O15056 1496 aa38.51■■■■□ 3.76
HACD1-201ENST00000326961 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.47■■■■□ 3.75
HACD1-201ENST00000326961 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.46■■■■□ 3.75
HACD1-201ENST00000326961 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.44■■■■□ 3.74
HACD1-201ENST00000326961 ADAMTS12P58397 1594 aa38.3■■■■□ 3.72
HACD1-201ENST00000326961 GRIN2AQ12879 1464 aa38.2■■■■□ 3.71
HACD1-201ENST00000326961 CEP170Q5SW79 1584 aa38.15■■■■□ 3.7
HACD1-201ENST00000326961 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.1■■■■□ 3.69
HACD1-201ENST00000326961 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.07■■■■□ 3.69
HACD1-201ENST00000326961 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.05■■■■□ 3.68
HACD1-201ENST00000326961 NUP160Q12769 1436 aa38.05■■■■□ 3.68
HACD1-201ENST00000326961 SHROOM2Q13796 1616 aa37.96■■■■□ 3.67
HACD1-201ENST00000326961 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
HACD1-201ENST00000326961 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.77■■■■□ 3.64
HACD1-201ENST00000326961 CUL7Q14999 1698 aa37.65■■■■□ 3.62
HACD1-201ENST00000326961 KIF27Q86VH2 1401 aa37.64■■■■□ 3.62
HACD1-201ENST00000326961 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms