Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETSIPP0DME0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETSIPP0DME0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETSIPP0DME0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETSIPP0DME0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETSIPP0DME0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETSIPP0DME0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETSIPP0DME0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETSIPP0DME0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETSIPP0DME0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETSIPP0DME0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETSIPP0DME0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETSIPP0DME0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETSIPP0DME0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETSIPP0DME0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETSIPP0DME0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms