RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333651.10

HMG20B-202, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HMG20B, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-202ENST00000333651 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.73■■■■■ 6.67
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HMG20B-202ENST00000333651 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.18■■■■■ 5.14
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HMG20B-202ENST00000333651 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.18■■■■■ 4.66
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HMG20B-202ENST00000333651 SMARCA2P51531 1590 aa43.6■■■■■ 4.57
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HMG20B-202ENST00000333651 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.47■■■■■ 4.55
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HMG20B-202ENST00000333651 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.34■■■■■ 4.37
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HMG20B-202ENST00000333651 CFTRP13569 1480 aa42.15■■■■■ 4.34
HMG20B-202ENST00000333651 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.13■■■■■ 4.33
HMG20B-202ENST00000333651 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.86■■■■■ 4.29
HMG20B-202ENST00000333651 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.85■■■■■ 4.29
HMG20B-202ENST00000333651 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.75■■■■■ 4.27
HMG20B-202ENST00000333651 PRDM2Q13029 1718 aa41.73■■■■■ 4.27
HMG20B-202ENST00000333651 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
HMG20B-202ENST00000333651 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.62■■■■■ 4.25
HMG20B-202ENST00000333651 CUX2O14529 1486 aa41.57■■■■■ 4.24
HMG20B-202ENST00000333651 WDR62O43379 1518 aa41.43■■■■■ 4.22
HMG20B-202ENST00000333651 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
HMG20B-202ENST00000333651 ABCC8Q09428 1581 aa41.25■■■■■ 4.19
HMG20B-202ENST00000333651 TOPBP1Q92547 1522 aa41.2■■■■■ 4.19
HMG20B-202ENST00000333651 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.15■■■■■ 4.18
HMG20B-202ENST00000333651 CUX1P39880 1505 aa40.99■■■■■ 4.15
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HMG20B-202ENST00000333651 IFT140Q96RY7 1462 aa40.87■■■■■ 4.13
HMG20B-202ENST00000333651 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.82■■■■■ 4.13
HMG20B-202ENST00000333651 SOGA1O94964 1423 aa40.78■■■■■ 4.12
HMG20B-202ENST00000333651 TOP2BQ02880 1626 aa40.72■■■■■ 4.11
HMG20B-202ENST00000333651 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.72■■■■■ 4.11
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HMG20B-202ENST00000333651 WDR97A6NE52 1622 aa40.37■■■■■ 4.05
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HMG20B-202ENST00000333651 TRIM41Q8WV44 630 aa40.27■■■■■ 4.04
HMG20B-202ENST00000333651 GRIN2BQ13224 1484 aa40.22■■■■■ 4.03
HMG20B-202ENST00000333651 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.19■■■■■ 4.02
HMG20B-202ENST00000333651 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.1■■■■■ 4.01
HMG20B-202ENST00000333651 PBRM1Q86U86 1689 aa40.07■■■■■ 4
HMG20B-202ENST00000333651 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
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HMG20B-202ENST00000333651 OSCARQ8IYS5 282 aa40.04■■■■■ 4
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HMG20B-202ENST00000333651 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
HMG20B-202ENST00000333651 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.4■■■■□ 3.9
HMG20B-202ENST00000333651 PRXQ9BXM0 1461 aa39.31■■■■□ 3.88
HMG20B-202ENST00000333651 ARHGEF11O15085 1522 aa39.26■■■■□ 3.87
HMG20B-202ENST00000333651 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.23■■■■□ 3.87
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