RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454765.6

TMEM171-202, Transcript of transmembrane protein 171, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM171, Length 1,535 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171-202ENST00000454765 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.89■■■■■ 6.86
TMEM171-202ENST00000454765 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.61■■■■■ 5.85
TMEM171-202ENST00000454765 ABCC9O60706 1549 aa50.5■■■■■ 5.67
TMEM171-202ENST00000454765 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.62■■■■■ 5.37
TMEM171-202ENST00000454765 NACADO15069 1562 aa48.54■■■■■ 5.36
TMEM171-202ENST00000454765 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.33■■■■■ 5.33
TMEM171-202ENST00000454765 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.25■■■■■ 5.31
TMEM171-202ENST00000454765 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.2■■■■■ 5.31
TMEM171-202ENST00000454765 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.97■■■■■ 5.27
TMEM171-202ENST00000454765 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.47■■■■■ 5.19
TMEM171-202ENST00000454765 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.12■■■■■ 5.13
TMEM171-202ENST00000454765 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.08■■■■■ 5.13
TMEM171-202ENST00000454765 SCRIBQ14160 1630 aa46.97■■■■■ 5.11
TMEM171-202ENST00000454765 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.73■■■■■ 5.07
TMEM171-202ENST00000454765 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.4■■■■■ 5.02
TMEM171-202ENST00000454765 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.94
TMEM171-202ENST00000454765 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.72■■■■■ 4.91
TMEM171-202ENST00000454765 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.43■■■■■ 4.86
TMEM171-202ENST00000454765 SMARCA4P51532 1647 aa44.96■■■■■ 4.79
TMEM171-202ENST00000454765 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.92■■■■■ 4.78
TMEM171-202ENST00000454765 NCAPD3P42695 1498 aa44.76■■■■■ 4.76
TMEM171-202ENST00000454765 SMARCA2P51531 1590 aa44.74■■■■■ 4.75
TMEM171-202ENST00000454765 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.74■■■■■ 4.75
TMEM171-202ENST00000454765 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.57■■■■■ 4.73
TMEM171-202ENST00000454765 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.56■■■■■ 4.72
TMEM171-202ENST00000454765 HMGXB3Q12766 1538 aa44.55■■■■■ 4.72
TMEM171-202ENST00000454765 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.38■■■■■ 4.7
TMEM171-202ENST00000454765 WIZO95785 1651 aa44.08■■■■■ 4.65
TMEM171-202ENST00000454765 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
TMEM171-202ENST00000454765 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
TMEM171-202ENST00000454765 NESP48681 1621 aa43.64■■■■■ 4.58
TMEM171-202ENST00000454765 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.63■■■■■ 4.58
TMEM171-202ENST00000454765 ERCC6Q03468 1493 aa43.6■■■■■ 4.57
TMEM171-202ENST00000454765 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.43■■■■■ 4.54
TMEM171-202ENST00000454765 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.34■■■■■ 4.53
TMEM171-202ENST00000454765 CUX2O14529 1486 aa43.23■■■■■ 4.51
TMEM171-202ENST00000454765 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.17■■■■■ 4.5
TMEM171-202ENST00000454765 CFTRP13569 1480 aa43.15■■■■■ 4.5
TMEM171-202ENST00000454765 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.1■■■■■ 4.49
TMEM171-202ENST00000454765 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
TMEM171-202ENST00000454765 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.93■■■■■ 4.46
TMEM171-202ENST00000454765 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.91■■■■■ 4.46
TMEM171-202ENST00000454765 PRDM2Q13029 1718 aa42.87■■■■■ 4.45
TMEM171-202ENST00000454765 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.87■■■■■ 4.45
TMEM171-202ENST00000454765 WDR62O43379 1518 aa42.74■■■■■ 4.43
TMEM171-202ENST00000454765 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
TMEM171-202ENST00000454765 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
TMEM171-202ENST00000454765 ABCC8Q09428 1581 aa42.3■■■■■ 4.36
TMEM171-202ENST00000454765 TOPBP1Q92547 1522 aa42.23■■■■■ 4.35
TMEM171-202ENST00000454765 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.19■■■■■ 4.34
TMEM171-202ENST00000454765 IFT140Q96RY7 1462 aa42.03■■■■■ 4.32
TMEM171-202ENST00000454765 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42■■■■■ 4.31
TMEM171-202ENST00000454765 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
TMEM171-202ENST00000454765 CUX1P39880 1505 aa41.83■■■■■ 4.29
TMEM171-202ENST00000454765 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
TMEM171-202ENST00000454765 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
TMEM171-202ENST00000454765 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.73■■■■■ 4.27
TMEM171-202ENST00000454765 SOGA1O94964 1423 aa41.67■■■■■ 4.26
TMEM171-202ENST00000454765 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
TMEM171-202ENST00000454765 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.62■■■■■ 4.25
TMEM171-202ENST00000454765 WDR97A6NE52 1622 aa41.54■■■■■ 4.24
TMEM171-202ENST00000454765 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.54■■■■■ 4.24
TMEM171-202ENST00000454765 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.52■■■■■ 4.24
TMEM171-202ENST00000454765 TOP2BQ02880 1626 aa41.48■■■■■ 4.23
TMEM171-202ENST00000454765 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.48■■■■■ 4.23
TMEM171-202ENST00000454765 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
TMEM171-202ENST00000454765 SYNJ1O43426 1573 aa41.41■■■■■ 4.22
TMEM171-202ENST00000454765 OSCARQ8IYS5 282 aa41.38■■■■■ 4.21
TMEM171-202ENST00000454765 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.35■■■■■ 4.21
TMEM171-202ENST00000454765 GRIN2BQ13224 1484 aa41.24■■■■■ 4.19
TMEM171-202ENST00000454765 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.22■■■■■ 4.19
TMEM171-202ENST00000454765 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.19■■■■■ 4.18
TMEM171-202ENST00000454765 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
TMEM171-202ENST00000454765 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.16■■■■■ 4.18
TMEM171-202ENST00000454765 CHD1O14646 1710 aa41.15■■■■■ 4.18
TMEM171-202ENST00000454765 PBRM1Q86U86 1689 aa41.14■■■■■ 4.18
TMEM171-202ENST00000454765 FBLN2P98095 1184 aa41.05■■■■■ 4.16
TMEM171-202ENST00000454765 SYNJ2O15056 1496 aa40.99■■■■■ 4.15
TMEM171-202ENST00000454765 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
TMEM171-202ENST00000454765 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.88■■■■■ 4.13
TMEM171-202ENST00000454765 ADAMTS12P58397 1594 aa40.81■■■■■ 4.12
TMEM171-202ENST00000454765 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.75■■■■■ 4.11
TMEM171-202ENST00000454765 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.71■■■■■ 4.11
TMEM171-202ENST00000454765 KIF27Q86VH2 1401 aa40.71■■■■■ 4.11
TMEM171-202ENST00000454765 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.7■■■■■ 4.11
TMEM171-202ENST00000454765 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.7■■■■■ 4.11
TMEM171-202ENST00000454765 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.7■■■■■ 4.11
TMEM171-202ENST00000454765 ARHGEF11O15085 1522 aa40.7■■■■■ 4.11
TMEM171-202ENST00000454765 GRIN2AQ12879 1464 aa40.7■■■■■ 4.11
TMEM171-202ENST00000454765 NUP160Q12769 1436 aa40.53■■■■■ 4.08
TMEM171-202ENST00000454765 IGF1RP08069 1367 aa40.51■■■■■ 4.08
TMEM171-202ENST00000454765 TRIM41Q8WV44 630 aa40.51■■■■■ 4.08
TMEM171-202ENST00000454765 CUL7Q14999 1698 aa40.49■■■■■ 4.07
TMEM171-202ENST00000454765 CEP170Q5SW79 1584 aa40.47■■■■■ 4.07
TMEM171-202ENST00000454765 ARAP1Q96P48 1450 aa40.33■■■■■ 4.05
TMEM171-202ENST00000454765 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.28■■■■■ 4.04
TMEM171-202ENST00000454765 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.28■■■■■ 4.04
TMEM171-202ENST00000454765 SHROOM2Q13796 1616 aa40.25■■■■■ 4.03
TMEM171-202ENST00000454765 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.21■■■■■ 4.03
TMEM171-202ENST00000454765 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.12■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms