Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRUB2O95900 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRUB2O95900 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRUB2O95900 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms