RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343730.9

MED22-201, Transcript of mediator complex subunit 22, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene MED22, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED22-201ENST00000343730 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.26■■■■■ 6.76
MED22-201ENST00000343730 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.84■■■■■ 5.73
MED22-201ENST00000343730 ABCC9O60706 1549 aa49.41■■■■■ 5.5
MED22-201ENST00000343730 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.79■■■■■ 5.24
MED22-201ENST00000343730 NACADO15069 1562 aa47.7■■■■■ 5.23
MED22-201ENST00000343730 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.69■■■■■ 5.22
MED22-201ENST00000343730 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.63■■■■■ 5.21
MED22-201ENST00000343730 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.51■■■■■ 5.2
MED22-201ENST00000343730 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.41■■■■■ 5.18
MED22-201ENST00000343730 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.61■■■■■ 5.05
MED22-201ENST00000343730 SCRIBQ14160 1630 aa46.38■■■■■ 5.02
MED22-201ENST00000343730 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.21■■■■■ 4.99
MED22-201ENST00000343730 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.15■■■■■ 4.98
MED22-201ENST00000343730 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.82■■■■■ 4.93
MED22-201ENST00000343730 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.01■■■■■ 4.8
MED22-201ENST00000343730 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
MED22-201ENST00000343730 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.73■■■■■ 4.75
MED22-201ENST00000343730 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.55■■■■■ 4.72
MED22-201ENST00000343730 SMARCA4P51532 1647 aa44.4■■■■■ 4.7
MED22-201ENST00000343730 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
MED22-201ENST00000343730 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.12■■■■■ 4.65
MED22-201ENST00000343730 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.05■■■■■ 4.64
MED22-201ENST00000343730 SMARCA2P51531 1590 aa44.05■■■■■ 4.64
MED22-201ENST00000343730 NCAPD3P42695 1498 aa43.98■■■■■ 4.63
MED22-201ENST00000343730 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.96■■■■■ 4.63
MED22-201ENST00000343730 HMGXB3Q12766 1538 aa43.84■■■■■ 4.61
MED22-201ENST00000343730 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
MED22-201ENST00000343730 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
MED22-201ENST00000343730 WIZO95785 1651 aa43.67■■■■■ 4.58
MED22-201ENST00000343730 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
MED22-201ENST00000343730 NESP48681 1621 aa42.83■■■■■ 4.45
MED22-201ENST00000343730 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.82■■■■■ 4.45
MED22-201ENST00000343730 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
MED22-201ENST00000343730 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.7■■■■■ 4.43
MED22-201ENST00000343730 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.69■■■■■ 4.42
MED22-201ENST00000343730 ERCC6Q03468 1493 aa42.59■■■■■ 4.41
MED22-201ENST00000343730 CFTRP13569 1480 aa42.53■■■■■ 4.4
MED22-201ENST00000343730 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.49■■■■■ 4.39
MED22-201ENST00000343730 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.38■■■■■ 4.38
MED22-201ENST00000343730 PRDM2Q13029 1718 aa42.3■■■■■ 4.36
MED22-201ENST00000343730 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.24■■■■■ 4.35
MED22-201ENST00000343730 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
MED22-201ENST00000343730 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.18■■■■■ 4.34
MED22-201ENST00000343730 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.06■■■■■ 4.32
MED22-201ENST00000343730 CUX2O14529 1486 aa42.05■■■■■ 4.32
MED22-201ENST00000343730 WDR62O43379 1518 aa41.92■■■■■ 4.3
MED22-201ENST00000343730 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
MED22-201ENST00000343730 ABCC8Q09428 1581 aa41.61■■■■■ 4.25
MED22-201ENST00000343730 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.6■■■■■ 4.25
MED22-201ENST00000343730 TOPBP1Q92547 1522 aa41.6■■■■■ 4.25
MED22-201ENST00000343730 CUX1P39880 1505 aa41.38■■■■■ 4.22
MED22-201ENST00000343730 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
MED22-201ENST00000343730 IFT140Q96RY7 1462 aa41.27■■■■■ 4.2
MED22-201ENST00000343730 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.19
MED22-201ENST00000343730 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.22■■■■■ 4.19
MED22-201ENST00000343730 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.14■■■■■ 4.18
MED22-201ENST00000343730 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
MED22-201ENST00000343730 TOP2BQ02880 1626 aa41.12■■■■■ 4.17
MED22-201ENST00000343730 SYNJ1O43426 1573 aa41.12■■■■■ 4.17
MED22-201ENST00000343730 SOGA1O94964 1423 aa41.07■■■■■ 4.16
MED22-201ENST00000343730 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.05■■■■■ 4.16
MED22-201ENST00000343730 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
MED22-201ENST00000343730 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
MED22-201ENST00000343730 WDR97A6NE52 1622 aa40.9■■■■■ 4.14
MED22-201ENST00000343730 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.83■■■■■ 4.13
MED22-201ENST00000343730 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.82■■■■■ 4.131e-7■■■■■ 27.3
MED22-201ENST00000343730 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
MED22-201ENST00000343730 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.67■■■■■ 4.1
MED22-201ENST00000343730 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.62■■■■■ 4.09
MED22-201ENST00000343730 GRIN2BQ13224 1484 aa40.59■■■■■ 4.09
MED22-201ENST00000343730 PBRM1Q86U86 1689 aa40.57■■■■■ 4.09
MED22-201ENST00000343730 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.5■■■■■ 4.07
MED22-201ENST00000343730 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
MED22-201ENST00000343730 TRIM41Q8WV44 630 aa40.38■■■■■ 4.05
MED22-201ENST00000343730 CHD1O14646 1710 aa40.37■■■■■ 4.05
MED22-201ENST00000343730 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.36■■■■■ 4.05
MED22-201ENST00000343730 KIF27Q86VH2 1401 aa40.34■■■■■ 4.05
MED22-201ENST00000343730 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.33■■■■■ 4.05
MED22-201ENST00000343730 SYNJ2O15056 1496 aa40.3■■■■■ 4.04
MED22-201ENST00000343730 OSCARQ8IYS5 282 aa40.27■■■■■ 4.04
MED22-201ENST00000343730 ADAMTS12P58397 1594 aa40.27■■■■■ 4.04
MED22-201ENST00000343730 FBLN2P98095 1184 aa40.26■■■■■ 4.04
MED22-201ENST00000343730 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
MED22-201ENST00000343730 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.16■■■■■ 4.02
MED22-201ENST00000343730 IGF1RP08069 1367 aa40.09■■■■■ 4.01
MED22-201ENST00000343730 CUL7Q14999 1698 aa40.07■■■■■ 4.01
MED22-201ENST00000343730 GRIN2AQ12879 1464 aa40.07■■■■■ 4.01
MED22-201ENST00000343730 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.07■■■■■ 4
MED22-201ENST00000343730 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.02■■■■■ 4
MED22-201ENST00000343730 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.93■■■■□ 3.98
MED22-201ENST00000343730 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.88■■■■□ 3.97
MED22-201ENST00000343730 NUP160Q12769 1436 aa39.88■■■■□ 3.97
MED22-201ENST00000343730 CEP170Q5SW79 1584 aa39.87■■■■□ 3.97
MED22-201ENST00000343730 EEA1Q15075 1411 aa39.77■■■■□ 3.96
MED22-201ENST00000343730 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.71■■■■□ 3.95
MED22-201ENST00000343730 ARHGEF11O15085 1522 aa39.7■■■■□ 3.95
MED22-201ENST00000343730 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.67■■■■□ 3.94
MED22-201ENST00000343730 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.67■■■■□ 3.94
MED22-201ENST00000343730 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.67■■■■□ 3.94
MED22-201ENST00000343730 PRXQ9BXM0 1461 aa39.63■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms