RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293745.6

KRT72-201, Transcript of keratin 72, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRT72, Length 2,015 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT72-201ENST00000293745 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.77■■■■■ 5.88
KRT72-201ENST00000293745 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.73■■■■■ 4.75
KRT72-201ENST00000293745 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
KRT72-201ENST00000293745 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.02■■■■■ 4.48
KRT72-201ENST00000293745 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.79■■■■■ 4.44
KRT72-201ENST00000293745 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.67■■■■■ 4.42
KRT72-201ENST00000293745 ABCC9O60706 1549 aa41.89■■■■■ 4.3
KRT72-201ENST00000293745 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.85■■■■■ 4.29
KRT72-201ENST00000293745 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
KRT72-201ENST00000293745 NACADO15069 1562 aa41.49■■■■■ 4.23
KRT72-201ENST00000293745 SCRIBQ14160 1630 aa41.45■■■■■ 4.23
KRT72-201ENST00000293745 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.02■■■■■ 4.16
KRT72-201ENST00000293745 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
KRT72-201ENST00000293745 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.35■■■■■ 4.05
KRT72-201ENST00000293745 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.28■■■■■ 4.04
KRT72-201ENST00000293745 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.2■■■■■ 4.03
KRT72-201ENST00000293745 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.1■■■■■ 4.01
KRT72-201ENST00000293745 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
KRT72-201ENST00000293745 WIZO95785 1651 aa39.87■■■■□ 3.97
KRT72-201ENST00000293745 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.83■■■■□ 3.97
KRT72-201ENST00000293745 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.71■■■■□ 3.95
KRT72-201ENST00000293745 SMARCA4P51532 1647 aa39.67■■■■□ 3.94
KRT72-201ENST00000293745 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
KRT72-201ENST00000293745 TRIM41Q8WV44 630 aa39.06■■■■□ 3.84
KRT72-201ENST00000293745 SMARCA2P51531 1590 aa39.05■■■■□ 3.84
KRT72-201ENST00000293745 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.05■■■■□ 3.84
KRT72-201ENST00000293745 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.02■■■■□ 3.84
KRT72-201ENST00000293745 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
KRT72-201ENST00000293745 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.83■■■■□ 3.81
KRT72-201ENST00000293745 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.8■■■■□ 3.8
KRT72-201ENST00000293745 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
KRT72-201ENST00000293745 ABCC8Q09428 1581 aa38.53■■■■□ 3.76
KRT72-201ENST00000293745 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
KRT72-201ENST00000293745 HMGXB3Q12766 1538 aa38.31■■■■□ 3.72
KRT72-201ENST00000293745 NCAPD3P42695 1498 aa38.3■■■■□ 3.72
KRT72-201ENST00000293745 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.09■■■■□ 3.69
KRT72-201ENST00000293745 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.08■■■■□ 3.69
KRT72-201ENST00000293745 SYNJ1O43426 1573 aa37.95■■■■□ 3.67
KRT72-201ENST00000293745 SOGA1O94964 1423 aa37.91■■■■□ 3.66
KRT72-201ENST00000293745 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.86■■■■□ 3.65
KRT72-201ENST00000293745 EEA1Q15075 1411 aa37.81■■■■□ 3.64
KRT72-201ENST00000293745 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.78■■■■□ 3.64
KRT72-201ENST00000293745 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.77■■■■□ 3.64
KRT72-201ENST00000293745 CFTRP13569 1480 aa37.69■■■■□ 3.62
KRT72-201ENST00000293745 TOP2BQ02880 1626 aa37.66■■■■□ 3.62
KRT72-201ENST00000293745 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.65■■■■□ 3.62
KRT72-201ENST00000293745 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.6■■■■□ 3.61
KRT72-201ENST00000293745 PRDM2Q13029 1718 aa37.57■■■■□ 3.6
KRT72-201ENST00000293745 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
KRT72-201ENST00000293745 CUX1P39880 1505 aa37.44■■■■□ 3.58
KRT72-201ENST00000293745 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.43■■■■□ 3.58
KRT72-201ENST00000293745 GOLGA3Q08378 1498 aa37.42■■■■□ 3.58
KRT72-201ENST00000293745 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.41■■■■□ 3.58
KRT72-201ENST00000293745 KIF21BO75037 1637 aa37.35■■■■□ 3.57
KRT72-201ENST00000293745 CEP162Q5TB80 1403 aa37.34■■■■□ 3.57
KRT72-201ENST00000293745 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
KRT72-201ENST00000293745 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.33■■■■□ 3.57
KRT72-201ENST00000293745 HRCP23327 699 aa37.19■■■■□ 3.54
KRT72-201ENST00000293745 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.09■■■■□ 3.53
KRT72-201ENST00000293745 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.06■■■■□ 3.52
KRT72-201ENST00000293745 KIF27Q86VH2 1401 aa37.03■■■■□ 3.52
KRT72-201ENST00000293745 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
KRT72-201ENST00000293745 NESP48681 1621 aa37.02■■■■□ 3.52
KRT72-201ENST00000293745 PRXQ9BXM0 1461 aa36.94■■■■□ 3.5
KRT72-201ENST00000293745 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.93■■■■□ 3.5
KRT72-201ENST00000293745 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.92■■■■□ 3.5
KRT72-201ENST00000293745 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.91■■■■□ 3.5
KRT72-201ENST00000293745 CLIP1P30622 1438 aa36.88■■■■□ 3.49
KRT72-201ENST00000293745 CUX2O14529 1486 aa36.84■■■■□ 3.49
KRT72-201ENST00000293745 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.83■■■■□ 3.49
KRT72-201ENST00000293745 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.83■■■■□ 3.49
KRT72-201ENST00000293745 TOPBP1Q92547 1522 aa36.74■■■■□ 3.47
KRT72-201ENST00000293745 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
KRT72-201ENST00000293745 IGF1RP08069 1367 aa36.64■■■■□ 3.46
KRT72-201ENST00000293745 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
KRT72-201ENST00000293745 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.62■■■■□ 3.45
KRT72-201ENST00000293745 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
KRT72-201ENST00000293745 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.62■■■■□ 3.45
KRT72-201ENST00000293745 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.59■■■■□ 3.45
KRT72-201ENST00000293745 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
KRT72-201ENST00000293745 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.54■■■■□ 3.44
KRT72-201ENST00000293745 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.54■■■■□ 3.44
KRT72-201ENST00000293745 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.48■■■■□ 3.43
KRT72-201ENST00000293745 ARAP1Q96P48 1450 aa36.44■■■■□ 3.42
KRT72-201ENST00000293745 WDR97A6NE52 1622 aa36.38■■■■□ 3.42
KRT72-201ENST00000293745 APLP2Q06481 763 aa36.34■■■■□ 3.41
KRT72-201ENST00000293745 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.29■■■■□ 3.4
KRT72-201ENST00000293745 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
KRT72-201ENST00000293745 CUL7Q14999 1698 aa36.27■■■■□ 3.4
KRT72-201ENST00000293745 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.21■■■■□ 3.39
KRT72-201ENST00000293745 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
KRT72-201ENST00000293745 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.13■■■■□ 3.37
KRT72-201ENST00000293745 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
KRT72-201ENST00000293745 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.12■■■■□ 3.37
KRT72-201ENST00000293745 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
KRT72-201ENST00000293745 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.03■■■■□ 3.36
KRT72-201ENST00000293745 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.34
KRT72-201ENST00000293745 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
KRT72-201ENST00000293745 PBRM1Q86U86 1689 aa35.9■■■■□ 3.34
KRT72-201ENST00000293745 WDR62O43379 1518 aa35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.4 ms