Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN3BO60391 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GRIN3BO60391 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN3BO60391 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1453 ms