RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449666.3

SLC47A1P1-202, Transcript of SLC47A1 pseudogene 1, humanhuman

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Gene SLC47A1P1, Length 945 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A1P1-202ENST00000449666 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.63■■■■■ 6.18
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.02■■■■■ 5.28
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ABCC9O60706 1549 aa47.97■■■■■ 5.27
SLC47A1P1-202ENST00000449666 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.72■■■■■ 4.91
SLC47A1P1-202ENST00000449666 NACADO15069 1562 aa45.4■■■■■ 4.86
SLC47A1P1-202ENST00000449666 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.02■■■■■ 4.8
SLC47A1P1-202ENST00000449666 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45■■■■■ 4.79
SLC47A1P1-202ENST00000449666 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.8■■■■■ 4.76
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
SLC47A1P1-202ENST00000449666 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.63■■■■■ 4.73
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.62■■■■■ 4.73
SLC47A1P1-202ENST00000449666 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.34■■■■■ 4.69
SLC47A1P1-202ENST00000449666 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.34■■■■■ 4.69
SLC47A1P1-202ENST00000449666 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.86■■■■■ 4.61
SLC47A1P1-202ENST00000449666 SCRIBQ14160 1630 aa43.66■■■■■ 4.58
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.37■■■■■ 4.53
SLC47A1P1-202ENST00000449666 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.25■■■■■ 4.51
SLC47A1P1-202ENST00000449666 NCAPD3P42695 1498 aa41.9■■■■■ 4.3
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.73■■■■■ 4.27
SLC47A1P1-202ENST00000449666 SMARCA4P51532 1647 aa41.68■■■■■ 4.26
SLC47A1P1-202ENST00000449666 SMARCA2P51531 1590 aa41.66■■■■■ 4.26
SLC47A1P1-202ENST00000449666 HMGXB3Q12766 1538 aa41.59■■■■■ 4.25
SLC47A1P1-202ENST00000449666 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ERCC6Q03468 1493 aa41.47■■■■■ 4.23
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CUX2O14529 1486 aa41.46■■■■■ 4.23
SLC47A1P1-202ENST00000449666 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.45■■■■■ 4.23
SLC47A1P1-202ENST00000449666 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.37■■■■■ 4.21
SLC47A1P1-202ENST00000449666 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.32■■■■■ 4.2
SLC47A1P1-202ENST00000449666 NESP48681 1621 aa41.18■■■■■ 4.18
SLC47A1P1-202ENST00000449666 WIZO95785 1651 aa41.01■■■■■ 4.15
SLC47A1P1-202ENST00000449666 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.99■■■■■ 4.15
SLC47A1P1-202ENST00000449666 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
SLC47A1P1-202ENST00000449666 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.75■■■■■ 4.11
SLC47A1P1-202ENST00000449666 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.68■■■■■ 4.1
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.61■■■■■ 4.09
SLC47A1P1-202ENST00000449666 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
SLC47A1P1-202ENST00000449666 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.37■■■■■ 4.05
SLC47A1P1-202ENST00000449666 WDR62O43379 1518 aa40.29■■■■■ 4.04
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.2■■■■■ 4.03
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CFTRP13569 1480 aa40.14■■■■■ 4.02
SLC47A1P1-202ENST00000449666 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.13■■■■■ 4.02
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.99■■■■□ 3.99
SLC47A1P1-202ENST00000449666 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PRDM2Q13029 1718 aa39.81■■■■□ 3.96
SLC47A1P1-202ENST00000449666 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
SLC47A1P1-202ENST00000449666 TRIM41Q8WV44 630 aa39.55■■■■□ 3.92
SLC47A1P1-202ENST00000449666 OSCARQ8IYS5 282 aa39.51■■■■□ 3.92
SLC47A1P1-202ENST00000449666 IFT140Q96RY7 1462 aa39.42■■■■□ 3.9
SLC47A1P1-202ENST00000449666 TOPBP1Q92547 1522 aa39.36■■■■□ 3.89
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ABCC8Q09428 1581 aa39.34■■■■□ 3.89
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
SLC47A1P1-202ENST00000449666 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.24■■■■□ 3.87
SLC47A1P1-202ENST00000449666 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
SLC47A1P1-202ENST00000449666 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
SLC47A1P1-202ENST00000449666 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39■■■■□ 3.83
SLC47A1P1-202ENST00000449666 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39■■■■□ 3.83
SLC47A1P1-202ENST00000449666 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39■■■■□ 3.83
SLC47A1P1-202ENST00000449666 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
SLC47A1P1-202ENST00000449666 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.92■■■■□ 3.82
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ARHGEF11O15085 1522 aa38.88■■■■□ 3.81
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CHD1O14646 1710 aa38.82■■■■□ 3.8
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CUX1P39880 1505 aa38.82■■■■□ 3.8
SLC47A1P1-202ENST00000449666 SOGA1O94964 1423 aa38.78■■■■□ 3.8
SLC47A1P1-202ENST00000449666 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.78■■■■□ 3.8
SLC47A1P1-202ENST00000449666 WDR97A6NE52 1622 aa38.71■■■■□ 3.79
SLC47A1P1-202ENST00000449666 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.7■■■■□ 3.79
SLC47A1P1-202ENST00000449666 FBLN2P98095 1184 aa38.68■■■■□ 3.78
SLC47A1P1-202ENST00000449666 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
SLC47A1P1-202ENST00000449666 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.56■■■■□ 3.76
SLC47A1P1-202ENST00000449666 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.55■■■■□ 3.76
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.55■■■■□ 3.76
SLC47A1P1-202ENST00000449666 SYNJ1O43426 1573 aa38.55■■■■□ 3.76
SLC47A1P1-202ENST00000449666 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.53■■■■□ 3.76
SLC47A1P1-202ENST00000449666 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
SLC47A1P1-202ENST00000449666 TOP2BQ02880 1626 aa38.51■■■■□ 3.76
SLC47A1P1-202ENST00000449666 GRIN2BQ13224 1484 aa38.47■■■■□ 3.75
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ARAP1Q96P48 1450 aa38.47■■■■□ 3.75
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.42■■■■□ 3.74
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.4■■■■□ 3.74
SLC47A1P1-202ENST00000449666 SYNJ2O15056 1496 aa38.36■■■■□ 3.73
SLC47A1P1-202ENST00000449666 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.32■■■■□ 3.72
SLC47A1P1-202ENST00000449666 PBRM1Q86U86 1689 aa38.3■■■■□ 3.72
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.29■■■■□ 3.72
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.23■■■■□ 3.71
SLC47A1P1-202ENST00000449666 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
SLC47A1P1-202ENST00000449666 GRIN2AQ12879 1464 aa37.97■■■■□ 3.67
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ADAMTS12P58397 1594 aa37.94■■■■□ 3.66
SLC47A1P1-202ENST00000449666 NUP160Q12769 1436 aa37.86■■■■□ 3.65
SLC47A1P1-202ENST00000449666 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.85■■■■□ 3.65
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.82■■■■□ 3.65
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CEP170Q5SW79 1584 aa37.82■■■■□ 3.65
SLC47A1P1-202ENST00000449666 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.73■■■■□ 3.63
SLC47A1P1-202ENST00000449666 SHROOM2Q13796 1616 aa37.7■■■■□ 3.63
SLC47A1P1-202ENST00000449666 KIF27Q86VH2 1401 aa37.7■■■■□ 3.62
SLC47A1P1-202ENST00000449666 CUL7Q14999 1698 aa37.54■■■■□ 3.6
SLC47A1P1-202ENST00000449666 IGF1RP08069 1367 aa37.51■■■■□ 3.59
SLC47A1P1-202ENST00000449666 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.48■■■■□ 3.59
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