Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAPC2Q13487 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SNAPC2Q13487 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNAPC2Q13487 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms