RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.27■■■■■ 6.44
CAPNS1-205ENST00000588780 ABCC9O60706 1549 aa50.8■■■■■ 5.72
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.86■■■■■ 5.57
CAPNS1-205ENST00000588780 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.26■■■■■ 5.32
CAPNS1-205ENST00000588780 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.93■■■■■ 5.26
CAPNS1-205ENST00000588780 NACADO15069 1562 aa47.37■■■■■ 5.17
CAPNS1-205ENST00000588780 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.35■■■■■ 5.17
CAPNS1-205ENST00000588780 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.25■■■■■ 5.15
CAPNS1-205ENST00000588780 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.74■■■■■ 5.07
CAPNS1-205ENST00000588780 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.46■■■■■ 5.03
CAPNS1-205ENST00000588780 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.37■■■■■ 5.01
CAPNS1-205ENST00000588780 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.81■■■■■ 4.92
CAPNS1-205ENST00000588780 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.76■■■■■ 4.92
CAPNS1-205ENST00000588780 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.74■■■■■ 4.91
CAPNS1-205ENST00000588780 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.61■■■■■ 4.89
CAPNS1-205ENST00000588780 SCRIBQ14160 1630 aa45.54■■■■■ 4.88
CAPNS1-205ENST00000588780 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.52■■■■■ 4.88
CAPNS1-205ENST00000588780 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
CAPNS1-205ENST00000588780 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.9■■■■■ 4.78
CAPNS1-205ENST00000588780 CUX2O14529 1486 aa44■■■■■ 4.63
CAPNS1-205ENST00000588780 ERCC6Q03468 1493 aa43.98■■■■■ 4.63
CAPNS1-205ENST00000588780 NCAPD3P42695 1498 aa43.74■■■■■ 4.59
CAPNS1-205ENST00000588780 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.53■■■■■ 4.56
CAPNS1-205ENST00000588780 SMARCA2P51531 1590 aa43.38■■■■■ 4.54
CAPNS1-205ENST00000588780 NESP48681 1621 aa43.37■■■■■ 4.53
CAPNS1-205ENST00000588780 HMGXB3Q12766 1538 aa43.32■■■■■ 4.53
CAPNS1-205ENST00000588780 SMARCA4P51532 1647 aa43.28■■■■■ 4.52
CAPNS1-205ENST00000588780 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
CAPNS1-205ENST00000588780 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
CAPNS1-205ENST00000588780 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
CAPNS1-205ENST00000588780 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.89■■■■■ 4.46
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM41Q8WV44 630 aa42.82■■■■■ 4.45
CAPNS1-205ENST00000588780 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.77■■■■■ 4.44
CAPNS1-205ENST00000588780 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.76■■■■■ 4.44
CAPNS1-205ENST00000588780 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.73■■■■■ 4.43
CAPNS1-205ENST00000588780 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.61■■■■■ 4.41
CAPNS1-205ENST00000588780 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.44■■■■■ 4.38
CAPNS1-205ENST00000588780 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.4■■■■■ 4.38
CAPNS1-205ENST00000588780 WDR62O43379 1518 aa42.25■■■■■ 4.35
CAPNS1-205ENST00000588780 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.11■■■■■ 4.33
CAPNS1-205ENST00000588780 WIZO95785 1651 aa42.07■■■■■ 4.33
CAPNS1-205ENST00000588780 OSCARQ8IYS5 282 aa42■■■■■ 4.31
CAPNS1-205ENST00000588780 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.98■■■■■ 4.31
CAPNS1-205ENST00000588780 CFTRP13569 1480 aa41.74■■■■■ 4.27
CAPNS1-205ENST00000588780 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
CAPNS1-205ENST00000588780 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
CAPNS1-205ENST00000588780 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.23
CAPNS1-205ENST00000588780 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.42■■■■■ 4.22
CAPNS1-205ENST00000588780 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.42■■■■■ 4.22
CAPNS1-205ENST00000588780 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.42■■■■■ 4.22
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
CAPNS1-205ENST00000588780 IFT140Q96RY7 1462 aa41.27■■■■■ 4.2
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGEF11O15085 1522 aa41.22■■■■■ 4.19
CAPNS1-205ENST00000588780 PRDM2Q13029 1718 aa41.21■■■■■ 4.19
CAPNS1-205ENST00000588780 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.13■■■■■ 4.17
CAPNS1-205ENST00000588780 TOPBP1Q92547 1522 aa41.07■■■■■ 4.16
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.04■■■■■ 4.16
CAPNS1-205ENST00000588780 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
CAPNS1-205ENST00000588780 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
CAPNS1-205ENST00000588780 ABCC8Q09428 1581 aa40.94■■■■■ 4.14
CAPNS1-205ENST00000588780 FBLN2P98095 1184 aa40.93■■■■■ 4.14
CAPNS1-205ENST00000588780 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.85■■■■■ 4.138e-9■□□□□ 10.5
CAPNS1-205ENST00000588780 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.84■■■■■ 4.13
CAPNS1-205ENST00000588780 CHD1O14646 1710 aa40.82■■■■■ 4.13
CAPNS1-205ENST00000588780 ARAP1Q96P48 1450 aa40.75■■■■■ 4.11
CAPNS1-205ENST00000588780 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
CAPNS1-205ENST00000588780 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
CAPNS1-205ENST00000588780 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
CAPNS1-205ENST00000588780 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.51■■■■■ 4.08
CAPNS1-205ENST00000588780 SOGA1O94964 1423 aa40.48■■■■■ 4.07
CAPNS1-205ENST00000588780 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
CAPNS1-205ENST00000588780 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
CAPNS1-205ENST00000588780 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.4■■■■■ 4.06
CAPNS1-205ENST00000588780 SYNJ1O43426 1573 aa40.29■■■■■ 4.04
CAPNS1-205ENST00000588780 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.28■■■■■ 4.04
CAPNS1-205ENST00000588780 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.26■■■■■ 4.04
CAPNS1-205ENST00000588780 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
CAPNS1-205ENST00000588780 WDR97A6NE52 1622 aa40.2■■■■■ 4.03
CAPNS1-205ENST00000588780 GRIN2BQ13224 1484 aa40.18■■■■■ 4.02
CAPNS1-205ENST00000588780 SYNJ2O15056 1496 aa40.11■■■■■ 4.01
CAPNS1-205ENST00000588780 CUX1P39880 1505 aa40.06■■■■■ 4
CAPNS1-205ENST00000588780 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.02■■■■■ 4
CAPNS1-205ENST00000588780 PBRM1Q86U86 1689 aa39.91■■■■□ 3.98
CAPNS1-205ENST00000588780 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.71■■■■□ 3.95
CAPNS1-205ENST00000588780 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.69■■■■□ 3.94
CAPNS1-205ENST00000588780 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.66■■■■□ 3.94
CAPNS1-205ENST00000588780 GRIN2AQ12879 1464 aa39.63■■■■□ 3.94
CAPNS1-205ENST00000588780 CEP170Q5SW79 1584 aa39.55■■■■□ 3.92
CAPNS1-205ENST00000588780 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.5■■■■□ 3.91
CAPNS1-205ENST00000588780 ADAMTS12P58397 1594 aa39.48■■■■□ 3.91
CAPNS1-205ENST00000588780 NUP160Q12769 1436 aa39.48■■■■□ 3.91
CAPNS1-205ENST00000588780 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.4■■■■□ 3.9
CAPNS1-205ENST00000588780 SHROOM2Q13796 1616 aa39.34■■■■□ 3.89
CAPNS1-205ENST00000588780 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.89
CAPNS1-205ENST00000588780 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
CAPNS1-205ENST00000588780 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.26■■■■□ 3.88
CAPNS1-205ENST00000588780 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.21■■■■□ 3.87
CAPNS1-205ENST00000588780 JPH4Q96JJ6 628 aa39.21■■■■□ 3.87
CAPNS1-205ENST00000588780 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.2■■■■□ 3.87
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.2■■■■□ 3.87
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