Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN1P53805 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN1P53805 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN1P53805 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN1P53805 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RCAN1P53805 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN1P53805 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN1P53805 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN1P53805 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN1P53805 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN1P53805 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN1P53805 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN1P53805 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN1P53805 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN1P53805 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN1P53805 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN1P53805 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN1P53805 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN1P53805 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN1P53805 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN1P53805 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN1P53805 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN1P53805 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN1P53805 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN1P53805 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN1P53805 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN1P53805 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN1P53805 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN1P53805 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN1P53805 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN1P53805 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN1P53805 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN1P53805 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN1P53805 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN1P53805 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RCAN1P53805 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN1P53805 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN1P53805 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN1P53805 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN1P53805 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN1P53805 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms