Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACLYP53396 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACLYP53396 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACLYP53396 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACLYP53396 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACLYP53396 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACLYP53396 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACLYP53396 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ACLYP53396 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ACLYP53396 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ACLYP53396 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ACLYP53396 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACLYP53396 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACLYP53396 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACLYP53396 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACLYP53396 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACLYP53396 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACLYP53396 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACLYP53396 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACLYP53396 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACLYP53396 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACLYP53396 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACLYP53396 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACLYP53396 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACLYP53396 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACLYP53396 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACLYP53396 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACLYP53396 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACLYP53396 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACLYP53396 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACLYP53396 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACLYP53396 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACLYP53396 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACLYP53396 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ACLYP53396 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACLYP53396 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACLYP53396 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACLYP53396 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACLYP53396 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACLYP53396 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACLYP53396 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACLYP53396 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACLYP53396 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACLYP53396 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ACLYP53396 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACLYP53396 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACLYP53396 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACLYP53396 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACLYP53396 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACLYP53396 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ACLYP53396 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACLYP53396 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACLYP53396 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACLYP53396 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACLYP53396 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACLYP53396 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACLYP53396 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACLYP53396 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACLYP53396 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACLYP53396 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACLYP53396 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACLYP53396 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACLYP53396 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACLYP53396 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ACLYP53396 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACLYP53396 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACLYP53396 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACLYP53396 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACLYP53396 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACLYP53396 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ACLYP53396 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACLYP53396 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACLYP53396 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACLYP53396 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACLYP53396 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACLYP53396 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACLYP53396 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACLYP53396 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACLYP53396 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ACLYP53396 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACLYP53396 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACLYP53396 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACLYP53396 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACLYP53396 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACLYP53396 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACLYP53396 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACLYP53396 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACLYP53396 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACLYP53396 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACLYP53396 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACLYP53396 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACLYP53396 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ACLYP53396 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACLYP53396 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACLYP53396 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACLYP53396 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACLYP53396 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACLYP53396 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACLYP53396 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACLYP53396 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms