Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMK4Q16566 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMK4Q16566 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMK4Q16566 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMK4Q16566 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMK4Q16566 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMK4Q16566 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMK4Q16566 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAMK4Q16566 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAMK4Q16566 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAMK4Q16566 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms