RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283148.11

UXS1-201, Transcript of UDP-glucuronate decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene UXS1, Length 2,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UXS1-201ENST00000283148 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.81■■■■■ 5.72
UXS1-201ENST00000283148 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.8■■■■■ 4.6
UXS1-201ENST00000283148 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
UXS1-201ENST00000283148 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.15■■■■■ 4.34
UXS1-201ENST00000283148 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.93■■■■■ 4.3
UXS1-201ENST00000283148 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.8■■■■■ 4.28
UXS1-201ENST00000283148 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.12■■■■■ 4.17
UXS1-201ENST00000283148 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
UXS1-201ENST00000283148 ABCC9O60706 1549 aa40.91■■■■■ 4.14
UXS1-201ENST00000283148 NACADO15069 1562 aa40.65■■■■■ 4.1
UXS1-201ENST00000283148 SCRIBQ14160 1630 aa40.55■■■■■ 4.08
UXS1-201ENST00000283148 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.11■■■■■ 4.01
UXS1-201ENST00000283148 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
UXS1-201ENST00000283148 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.58■■■■□ 3.93
UXS1-201ENST00000283148 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.53■■■■□ 3.92
UXS1-201ENST00000283148 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.42■■■■□ 3.9
UXS1-201ENST00000283148 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.35■■■■□ 3.89
UXS1-201ENST00000283148 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
UXS1-201ENST00000283148 WIZO95785 1651 aa39.05■■■■□ 3.84
UXS1-201ENST00000283148 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.02■■■■□ 3.84
UXS1-201ENST00000283148 SMARCA4P51532 1647 aa38.88■■■■□ 3.81
UXS1-201ENST00000283148 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.8■■■■□ 3.8
UXS1-201ENST00000283148 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
UXS1-201ENST00000283148 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.35■■■■□ 3.73
UXS1-201ENST00000283148 TRIM41Q8WV44 630 aa38.34■■■■□ 3.73
UXS1-201ENST00000283148 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.34■■■■□ 3.73
UXS1-201ENST00000283148 SMARCA2P51531 1590 aa38.3■■■■□ 3.72
UXS1-201ENST00000283148 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.29■■■■□ 3.72
UXS1-201ENST00000283148 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.16■■■■□ 3.7
UXS1-201ENST00000283148 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.08■■■■□ 3.69
UXS1-201ENST00000283148 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
UXS1-201ENST00000283148 ABCC8Q09428 1581 aa37.78■■■■□ 3.64
UXS1-201ENST00000283148 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.64
UXS1-201ENST00000283148 NCAPD3P42695 1498 aa37.58■■■■□ 3.61
UXS1-201ENST00000283148 HMGXB3Q12766 1538 aa37.55■■■■□ 3.6
UXS1-201ENST00000283148 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.37■■■■□ 3.57
UXS1-201ENST00000283148 SOGA1O94964 1423 aa37.25■■■■□ 3.55
UXS1-201ENST00000283148 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.25■■■■□ 3.55
UXS1-201ENST00000283148 SYNJ1O43426 1573 aa37.22■■■■□ 3.55
UXS1-201ENST00000283148 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.21■■■■□ 3.55
UXS1-201ENST00000283148 EEA1Q15075 1411 aa37.17■■■■□ 3.54
UXS1-201ENST00000283148 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.1■■■■□ 3.53
UXS1-201ENST00000283148 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.99■■■■□ 3.51
UXS1-201ENST00000283148 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.99■■■■□ 3.51
UXS1-201ENST00000283148 CFTRP13569 1480 aa36.99■■■■□ 3.51
UXS1-201ENST00000283148 TOP2BQ02880 1626 aa36.95■■■■□ 3.51
UXS1-201ENST00000283148 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
UXS1-201ENST00000283148 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.88■■■■□ 3.49
UXS1-201ENST00000283148 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.81■■■■□ 3.48
UXS1-201ENST00000283148 HRCP23327 699 aa36.75■■■■□ 3.47
UXS1-201ENST00000283148 GOLGA3Q08378 1498 aa36.74■■■■□ 3.47
UXS1-201ENST00000283148 CUX1P39880 1505 aa36.72■■■■□ 3.47
UXS1-201ENST00000283148 PRDM2Q13029 1718 aa36.72■■■■□ 3.47
UXS1-201ENST00000283148 CEP162Q5TB80 1403 aa36.7■■■■□ 3.47
UXS1-201ENST00000283148 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.69■■■■□ 3.46
UXS1-201ENST00000283148 KIF21BO75037 1637 aa36.68■■■■□ 3.46
UXS1-201ENST00000283148 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.66■■■■□ 3.46
UXS1-201ENST00000283148 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
UXS1-201ENST00000283148 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.44■■■■□ 3.42
UXS1-201ENST00000283148 PRXQ9BXM0 1461 aa36.33■■■■□ 3.41
UXS1-201ENST00000283148 KIF27Q86VH2 1401 aa36.32■■■■□ 3.41
UXS1-201ENST00000283148 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
UXS1-201ENST00000283148 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.29■■■■□ 3.4
UXS1-201ENST00000283148 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.28■■■■□ 3.4
UXS1-201ENST00000283148 CLIP1P30622 1438 aa36.22■■■■□ 3.39
UXS1-201ENST00000283148 NESP48681 1621 aa36.21■■■■□ 3.39
UXS1-201ENST00000283148 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.18■■■■□ 3.38
UXS1-201ENST00000283148 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.12■■■■□ 3.37
UXS1-201ENST00000283148 CUX2O14529 1486 aa36.09■■■■□ 3.37
UXS1-201ENST00000283148 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.07■■■■□ 3.36
UXS1-201ENST00000283148 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.04■■■■□ 3.36
UXS1-201ENST00000283148 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.01■■■■□ 3.36
UXS1-201ENST00000283148 IGF1RP08069 1367 aa36■■■■□ 3.35
UXS1-201ENST00000283148 TOPBP1Q92547 1522 aa35.99■■■■□ 3.35
UXS1-201ENST00000283148 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
UXS1-201ENST00000283148 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
UXS1-201ENST00000283148 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.85■■■■□ 3.33
UXS1-201ENST00000283148 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
UXS1-201ENST00000283148 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.84■■■■□ 3.33
UXS1-201ENST00000283148 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
UXS1-201ENST00000283148 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.83■■■■□ 3.33
UXS1-201ENST00000283148 ARAP1Q96P48 1450 aa35.8■■■■□ 3.32
UXS1-201ENST00000283148 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.79■■■■□ 3.32
UXS1-201ENST00000283148 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
UXS1-201ENST00000283148 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.68■■■■□ 3.3
UXS1-201ENST00000283148 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.66■■■■□ 3.3
UXS1-201ENST00000283148 WDR97A6NE52 1622 aa35.64■■■■□ 3.3
UXS1-201ENST00000283148 APLP2Q06481 763 aa35.6■■■■□ 3.29
UXS1-201ENST00000283148 CUL7Q14999 1698 aa35.52■■■■□ 3.28
UXS1-201ENST00000283148 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.49■■■■□ 3.27
UXS1-201ENST00000283148 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
UXS1-201ENST00000283148 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
UXS1-201ENST00000283148 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
UXS1-201ENST00000283148 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.38■■■■□ 3.26
UXS1-201ENST00000283148 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.34■■■■□ 3.25
UXS1-201ENST00000283148 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
UXS1-201ENST00000283148 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
UXS1-201ENST00000283148 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.25■■■■□ 3.23
UXS1-201ENST00000283148 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.19■■■■□ 3.22
UXS1-201ENST00000283148 MAP3K1Q13233 1512 aa35.19■■■■□ 3.22
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