RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382477.6

CBARP-202, Transcript of CACN subunit beta associated regulatory protein, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CBARP, Length 2,453 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARP-202ENST00000382477 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.31■■■■■ 5.8
CBARP-202ENST00000382477 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.19■■■■■ 4.66
CBARP-202ENST00000382477 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
CBARP-202ENST00000382477 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.8■■■■■ 4.44
CBARP-202ENST00000382477 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.76■■■■■ 4.44
CBARP-202ENST00000382477 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.12■■■■■ 4.33
CBARP-202ENST00000382477 ABCC9O60706 1549 aa41.93■■■■■ 4.3
CBARP-202ENST00000382477 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
CBARP-202ENST00000382477 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.35■■■■■ 4.21
CBARP-202ENST00000382477 SCRIBQ14160 1630 aa41.19■■■■■ 4.18
CBARP-202ENST00000382477 NACADO15069 1562 aa41.12■■■■■ 4.17
CBARP-202ENST00000382477 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.7■■■■■ 4.11
CBARP-202ENST00000382477 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
CBARP-202ENST00000382477 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.12■■■■■ 4.01
CBARP-202ENST00000382477 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.11■■■■■ 4.01
CBARP-202ENST00000382477 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.84■■■■□ 3.97
CBARP-202ENST00000382477 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.84■■■■□ 3.97
CBARP-202ENST00000382477 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.7■■■■□ 3.95
CBARP-202ENST00000382477 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.69■■■■□ 3.94
CBARP-202ENST00000382477 WIZO95785 1651 aa39.55■■■■□ 3.92
CBARP-202ENST00000382477 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
CBARP-202ENST00000382477 SMARCA4P51532 1647 aa39.32■■■■□ 3.89
CBARP-202ENST00000382477 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
CBARP-202ENST00000382477 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.72■■■■□ 3.79
CBARP-202ENST00000382477 SMARCA2P51531 1590 aa38.67■■■■□ 3.78
CBARP-202ENST00000382477 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.65■■■■□ 3.78
CBARP-202ENST00000382477 TRIM41Q8WV44 630 aa38.63■■■■□ 3.77
CBARP-202ENST00000382477 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.61■■■■□ 3.77
CBARP-202ENST00000382477 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
CBARP-202ENST00000382477 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.47■■■■□ 3.75
CBARP-202ENST00000382477 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
CBARP-202ENST00000382477 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
CBARP-202ENST00000382477 ABCC8Q09428 1581 aa38.22■■■■□ 3.71
CBARP-202ENST00000382477 NCAPD3P42695 1498 aa38.07■■■■□ 3.69
CBARP-202ENST00000382477 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.97■■■■□ 3.67
CBARP-202ENST00000382477 HMGXB3Q12766 1538 aa37.96■■■■□ 3.67
CBARP-202ENST00000382477 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.77■■■■□ 3.64
CBARP-202ENST00000382477 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.7■■■■□ 3.63
CBARP-202ENST00000382477 SOGA1O94964 1423 aa37.63■■■■□ 3.61
CBARP-202ENST00000382477 SYNJ1O43426 1573 aa37.61■■■■□ 3.61
CBARP-202ENST00000382477 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.54■■■■□ 3.6
CBARP-202ENST00000382477 CFTRP13569 1480 aa37.43■■■■□ 3.58
CBARP-202ENST00000382477 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.26■■■■□ 3.55
CBARP-202ENST00000382477 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.24■■■■□ 3.55
CBARP-202ENST00000382477 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.24■■■■□ 3.55
CBARP-202ENST00000382477 TOP2BQ02880 1626 aa37.23■■■■□ 3.55
CBARP-202ENST00000382477 CUX1P39880 1505 aa37.17■■■■□ 3.54
CBARP-202ENST00000382477 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.16■■■■□ 3.54
CBARP-202ENST00000382477 EEA1Q15075 1411 aa37.15■■■■□ 3.54
CBARP-202ENST00000382477 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.12■■■■□ 3.53
CBARP-202ENST00000382477 PRDM2Q13029 1718 aa37.04■■■■□ 3.52
CBARP-202ENST00000382477 NESP48681 1621 aa37.02■■■■□ 3.52
CBARP-202ENST00000382477 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
CBARP-202ENST00000382477 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.87■■■■□ 3.49
CBARP-202ENST00000382477 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.87■■■■□ 3.49
CBARP-202ENST00000382477 GOLGA3Q08378 1498 aa36.86■■■■□ 3.49
CBARP-202ENST00000382477 CEP162Q5TB80 1403 aa36.84■■■■□ 3.49
CBARP-202ENST00000382477 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
CBARP-202ENST00000382477 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.79■■■■□ 3.48
CBARP-202ENST00000382477 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.76■■■■□ 3.48
CBARP-202ENST00000382477 KIF21BO75037 1637 aa36.75■■■■□ 3.47
CBARP-202ENST00000382477 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
CBARP-202ENST00000382477 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.67■■■■□ 3.46
CBARP-202ENST00000382477 KIF27Q86VH2 1401 aa36.63■■■■□ 3.45
CBARP-202ENST00000382477 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.61■■■■□ 3.45
CBARP-202ENST00000382477 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
CBARP-202ENST00000382477 CUX2O14529 1486 aa36.56■■■■□ 3.44
CBARP-202ENST00000382477 PRXQ9BXM0 1461 aa36.55■■■■□ 3.44
CBARP-202ENST00000382477 TOPBP1Q92547 1522 aa36.51■■■■□ 3.44
CBARP-202ENST00000382477 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.49■■■■□ 3.43
CBARP-202ENST00000382477 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.47■■■■□ 3.43
CBARP-202ENST00000382477 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
CBARP-202ENST00000382477 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
CBARP-202ENST00000382477 CLIP1P30622 1438 aa36.41■■■■□ 3.42
CBARP-202ENST00000382477 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
CBARP-202ENST00000382477 IGF1RP08069 1367 aa36.4■■■■□ 3.42
CBARP-202ENST00000382477 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.39■■■■□ 3.42
CBARP-202ENST00000382477 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.37■■■■□ 3.41
CBARP-202ENST00000382477 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.37■■■■□ 3.41
CBARP-202ENST00000382477 HRCP23327 699 aa36.3■■■■□ 3.4
CBARP-202ENST00000382477 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.22■■■■□ 3.39
CBARP-202ENST00000382477 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.19■■■■□ 3.38
CBARP-202ENST00000382477 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CBARP-202ENST00000382477 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.09■■■■□ 3.37
CBARP-202ENST00000382477 ARAP1Q96P48 1450 aa36.02■■■■□ 3.36
CBARP-202ENST00000382477 WDR97A6NE52 1622 aa36.01■■■■□ 3.36
CBARP-202ENST00000382477 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.93■■■■□ 3.34
CBARP-202ENST00000382477 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.91■■■■□ 3.34
CBARP-202ENST00000382477 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
CBARP-202ENST00000382477 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.88■■■■□ 3.33
CBARP-202ENST00000382477 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.87■■■■□ 3.33
CBARP-202ENST00000382477 APLP2Q06481 763 aa35.77■■■■□ 3.32
CBARP-202ENST00000382477 CUL7Q14999 1698 aa35.77■■■■□ 3.32
CBARP-202ENST00000382477 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.75■■■■□ 3.313e-7■■■■■ 36.6
CBARP-202ENST00000382477 ERCC6Q03468 1493 aa35.74■■■■□ 3.31
CBARP-202ENST00000382477 P3H3Q8IVL6 736 aa35.72■■■■□ 3.31
CBARP-202ENST00000382477 WDR62O43379 1518 aa35.69■■■■□ 3.3
CBARP-202ENST00000382477 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
CBARP-202ENST00000382477 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
CBARP-202ENST00000382477 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
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