Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms