Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PUS10Q3MIT2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PUS10Q3MIT2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PUS10Q3MIT2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms