Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCCD1A6NED2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RCCD1A6NED2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCCD1A6NED2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms