Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PYM1Q9BRP8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PYM1Q9BRP8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PYM1Q9BRP8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PYM1Q9BRP8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms