Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPA33Q99795 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPA33Q99795 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPA33Q99795 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms