Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAF2Q96CS3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAF2Q96CS3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FAF2Q96CS3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms